معمل التكرير الحيوي (بالإنجليزية: Biorefinery) هو منشأة تشبه مصفاة البترول التي تضم خطوات المعالجة المختلفة أو عمليات الوحدة، وتتصل بالمعدات لإنتاج منتجات حيوية مختلفة، بما في ذلك الوقود والطاقة والمواد الكيميائية من الكتلة الحيوية.[1] ودائمًا ما يتم اعتبار مصافي التكرير الحيوية الصناعية الطريق الأفضل لإنشاء صناعة حيوية محلية جديدة تنتج مجموعة كاملة من المنتجات الحيوية أو المنتجات القائمة على الكائنات الحية.