اونترى
اونترى (IPA: [ɒnˈtreɪ]</link> ) [1] نظام البحث عبر قواعد البيانات العالمية هو محرك بحث موحد أو بوابة ويب تسمح للمستخدمين بالبحث في عديد من قواعد بيانات العلوم الصحية المنفصلة على موقع المركز الوطني لمعلومات التكنولوجيا الحيوية (NCBI). [2] يعد المركز الوطني لمعلومات البيولوجيا الحيوية جزءًا من المكتبة الوطنية للطب (NLM)، والتي تعد في حد ذاتها قسمًا من المعاهد الوطنية للصحة (NIH)، والتي بدورها تعد جزءًا من وزارة الصحة والخدمات الإنسانية في الولايات المتحدة . تم اختيار اسم "اونترى" (تحية تعني "تفضل" باللغة الفرنسية) ليعكس روح الترحيب بالجمهور للبحث في المحتوى المتاح من المكتبة الوطنية للطب.
اونترى Global Query هو نظام بحث واسترجاع متكامل يوفر إمكانية الوصول إلى جميع قواعد البيانات في وقت واحد باستخدام سلسلة استعلام واحدة وواجهة مستخدم واحدة. يمكن لـ اونترى استرجاع التسلسلات والهياكل والمراجع ذات الصلة بكفاءة. يمكن لنظام اونترى توفير عرض لتسلسلات الجينات والبروتينات وخرائط الكروموسومات . بعض الكتب المدرسية متاحة أيضًا عبر الإنترنت من خلال نظام اونترى.
سمات
[تعديل]صفحة اونترى الرئيسية ، بشكل افتراضي، توفر إمكانية الوصول إلى الاستعلام العالمي. يمكن البحث في جميع قواعد البيانات المُفهرسة بواسطة اونترى عبر سلسلة استعلام واحدة، ودعم المشغلات المنطقية وعلامات مصطلحات البحث للحد من أجزاء من عبارة البحث إلى حقول معينة. يؤدي هذا إلى إرجاع صفحة نتائج موحدة، تعرض عدد النتائج للبحث في كل قاعدة بيانات، والتي ترتبط أيضًا بنتائج البحث الفعلية لقاعدة البيانات المحددة.
يوفر اونترى أيضًا واجهة مشابهة للبحث في كل قاعدة بيانات معينة ولتحسين نتائج البحث. تتيح ميزة الحدود للمستخدم تضييق نطاق البحث، وهي عبارة عن واجهة نماذج الويب. توفر ميزة "السجل" قائمة مرقمة بالاستعلامات التي تم إجراؤها مؤخرًا. من الممكن الإشارة إلى نتائج الاستعلامات السابقة من خلال الرقم ودمجها عبر المشغلات المنطقية. يمكن حفظ نتائج البحث مؤقتًا في الحافظة. يمكن للمستخدمين الذين لديهم حساب MyNCBI حفظ الاستعلامات إلى أجل غير مسمى، كما يمكنهم اختيار تلقي التحديثات بنتائج البحث الجديدة عبر البريد الإلكتروني للاستعلامات المحفوظة لمعظم قواعد البيانات. يتم استخدامه على نطاق واسع في مجال التكنولوجيا الحيوية كأداة مرجعية للطلاب والمحترفين على حد سواء.
قواعد البيانات
[تعديل]اونترى يبحث في قواعد البيانات :
- PubMed : الاستشهادات والملخصات الأدبية الطبية الحيوية، بما في ذلك Medline - مقالات من المجلات ( الطبية في الغالب)، والتي غالبًا ما تتضمن ملخصات. تتوفر روابط إلى PubMed Central وموارد النصوص الكاملة الأخرى للمقالات من تسعينيات القرن العشرين.
- PubMed Central : مقالات مجانية كاملة النصوص
- البحث في الموقع: مواقع الويب التابعة لـ NCBI ومواقع الويب الخاصة بـ FTP
- كتب: كتب على الانترنت
- الوراثة المندلية عبر الإنترنت في الإنسان (OMIM)
- قاعدة بيانات تسلسل النوكليوتيدات ( GenBank )
- البروتين : قاعدة بيانات التسلسل ( GenPept )
- الجينوم : تسلسل الجينوم الكامل ورسم الخرائط
- البنية : هياكل جزيئية ثلاثية الأبعاد
- التصنيف : الكائنات الحية في بنك الجينات التصنيف
- dbSNP : تعدد أشكال النوكليوتيدات المفردة
- الجين : [3] معلومات مركزية حول الجين
- HomoloGene : مجموعات التماثل في الكائنات حقيقية النواة
- مركب PubChem : هياكل كيميائية فريدة من نوعها لجزيئات صغيرة
- PubChem Substance: سجلات المواد الكيميائية المودعة
- مشروع الجينوم : معلومات عن مشروع الجينوم
- UniGene : مجموعات من تسلسلات النسخ الموجهة للجينات
- CDD : قاعدة بيانات نطاقات البروتين المحفوظة
- PopSet : مجموعات بيانات دراسة السكان ( علم الأوبئة )
- ملفات تعريف GEO : ملفات تعريف التعبير والوفرة الجزيئية
- مجموعات بيانات GEO : مجموعات تجريبية من بيانات GEO
- أرشيف قراءة التسلسل : بيانات التسلسل عالية الإنتاجية
- كروموسومات السرطان : قواعد البيانات الخلوية الوراثية
- PubChem BioAssay : فحص النشاط الحيوي للمواد الكيميائية
- المسبار : الكواشف الخاصة بالتسلسل
- فهرس المكتبة الوطنية للطب : بيانات ببليوغرافية من المكتبة الوطنية للطب لأكثر من 1.2 مليون مجلة وكتاب ومواد سمعية وبصرية وبرامج كمبيوتر وموارد إلكترونية ومواد أخرى مقيمة في LocatorPlus (يتم تحديثها كل يوم من أيام الأسبوع).
وصول
[تعديل]بالإضافة إلى استخدام نماذج محرك البحث للاستعلام عن البيانات في اونترى، يوفر NCBI أدوات برمجة اونترى (eUtils) للوصول المباشر إلى نتائج الاستعلام. يتم الوصول إلى eUtils عن طريق نشر عناوين URL التي تم تشكيلها خصيصًا إلى خادم NCBI، وتحليل استجابة XML. كانت هناك أيضًا واجهة eUtils SOAP والتي تم إنهاؤها في يوليو 2015.
تاريخ
[تعديل]تم تقديم اونترى في عام 1991، على شكل قرص مضغوط. في عام 1993، تم توفير نسخة من البرنامج مخصصة للعميل والخادم تتيح الاتصال بالإنترنت. في عام 1994، أنشأت NCBI موقعًا على الويب، وكان اونترى جزءًا من هذا الإصدار الأولي. في عام 2001، تم إصدار مكتبة اونترى وفي عام 2003، تم تطوير قاعدة بيانات اونترى Gene. [4]
مراجع
[تعديل]- ↑ "Definition of 'entrez'". Collins Dictionary [Internet].
- ↑ NCBI Resource Coordinators (2012). "Database resources of the National Center for Biotechnology Information". Nucleic Acids Research. 41 (Database issue): D8 – D20. doi:10.1093/nar/gks1189. PMC 3531099. PMID 23193264.
- ↑ "Home - Gene - NCBI".
- ↑ Smith, Kent. "A Brief History of NCBI's Formation and Growth". The NCBI Handbook [Internet]. 2nd edition. Retrieved 3 May 2014.