Основан като професионален клуб през 2013 година на базата на Националната футболна академия, създадена през 2006 с участието на УЕФА. За два сезона се изкачва от втора дивизиона във висшата. В дебютния си сезон във висшата дивизия заема седмото място, на следващия сезон – петото.
Два пъти, през 2015 и 2016 години, е полуфиналист в Купата на Литва. През 2017 „Стумбрас“ печели този трофей, който става първи в историята на клуба.
През лятото 2019 г. клубът престана да съществува. Накрая те бяха елиминирани от елитната дивизия.[1]
Играе на главния стадион в Каунас – С. Дарюс и С. Гиренас, с капацитет 9180 зрители. Резервен е стадионът на Националната футболна академия, който е за 500 зрители.