একটি আধুনিক ট্রান্সমিশন ইলেক্ট্রন মাইক্রোস্কোপ একটি স্ক্যানিং ইলেক্ট্রন মাইক্রোস্কোপে একটি পিঁপড়ার একটি চিত্র৷
একটি ইলেক্ট্রন অণুবীক্ষণ যন্ত্র এমন একটি মাইক্রোস্কোপ যা আলোক উৎস হিসাবে ইলেকট্রন ব্যবহার করে। এটি ইলেকট্রন অপটিক্স ব্যবহার করে; যা একটি অপটিক্যাল লাইট মাইক্রোস্কোপের গ্লাস লেন্সের সাথে সাদৃশ্যপূর্ণ। একটি ইলেক্ট্রনের তরঙ্গদৈর্ঘ্য দৃশ্যমান আলোর চেয়ে ১০০,০০০ গুণ কম হওয়ায় ইলেকট্রন মাইক্রোস্কোপের উচ্চতর রেজোলিউশন প্রায় ০.১ ন্যানোমিটার থাকে, যা আলোক অণুবীক্ষণ যন্ত্রের জন্য প্রায় ২০০ ন্যানোমিটারের সাথে তুলনীয়। ইলেক্ট্রন অণুবীক্ষণ যন্ত্র উল্লেখ করতে পারে:
ট্রান্সমিশন ইলেক্ট্রন মাইক্রোস্কোপি (টিইএম); যেখানে দ্রুতগামী ইলেকট্রন একটি পাতলা নমুনার মধ্য দিয়ে যায়
স্ক্যানিং ট্রান্সমিশন ইলেক্ট্রন মাইক্রোস্কোপি (এসটিইএম); একটি স্ক্যান করা ইলেক্ট্রন প্রোবের সাথে 'টিইএম'-এর অনুরূপ