Protein 1 Alstromovog sindruma znan i kao ALMS1 jest protein koji je kod ljudi kodiran genom ALMS1 sa hromosoma 2 .[ 1] [ 2]
Gen se nalazi na kratkom kraku hromosoma 2 (2p13.2) na plus (Watson) lancu. Dužine je 224.161 baza organizovan u 23 egzona . Kodirani protein ima 4.167 aminokiselina i molekulsku težinu od 460.937 Da. Poznata su tri izoforme , odnosno varijante transkripta . Sam protein ima veliki tandemski domen sa ponavljanjem koji se sastoji od 34 nesavršena ponavljanja od po 47 aminokiselina. Mutacije povezane s bolešću obično se nalaze u egzonima 8, 10 i 16.
Gen je eksprimiran u fetusnim tkivima organa, kao što su aorta , mozak , oko , bubreg , jetra , pluća , mirisni režanj , pankreas , skeletni mišići , slezena i sjemenici . Protein se nalazi u citoplazmi , centrosomu , ćelijskim projekcijama i baznim tijelima cilija . Tokom mitoze lokalizira se na oba pola vretena .
Nokdaun kratke interferirajuće RNK Alms1 u mišjim unutrašnjim ćelijama sržnih sabirnih kanala uzrokuje defektnu ciliogenezu . Cilije su zakržljale i tretirane ćelije nisu imale sposobnost da povećaju priliv kalcija kao odgovor na mehaničke stimuluse.[ 3]
Utvrđeno je da mutacije u genu ALMS1 uzrokuju Alströmov sindrom s ukupno 81 mutacijom bolesti koju uzrokuje.[ 4]
Poznato je više mutacija: 2007. ukupno je 79. To uključuje i nonsens mutacije i mutacije sa pomakom okvira. Većina mutacija je pronađena u egzonima 8,10 i 16.
Jackson Laboratory u Bar Harboru, Maine , SAD sa Univerzitetom u Southamptonu , UK izolovao je ALMS1 kao jedini gen odgovoran za Alströmov sindrom .[ 1]
^ a b Collin GB, Marshall JD, Cardon LR, Nishina PM (February 1997). "Homozygosity mapping at Alström syndrome to chromosome 2p" . Hum. Mol. Genet . 6 (2): 213–219. doi :10.1093/hmg/6.2.213 . PMID 9063741 .
^ Nagase T, Ishikawa K, Nakajima D, Ohira M, Seki N, Miyajima N, Tanaka A, Kotani H, Nomura N, Ohara O (April 1997). "Prediction of the coding sequences of unidentified human genes. VII. The complete sequences of 100 new cDNA clones from brain which can code for large proteins in vitro" . DNA Res . 4 (2): 141–150. doi :10.1093/dnares/4.2.141 . PMID 9205841 .
^ Li G, Vega R, Nelms K, Gekakis N, Goodnow C, McNamara P, Wu H, Hong NA, Glynne R (January 2007). "A role for Alström syndrome protein, alms1, in kidney ciliogenesis and cellular quiescence" . PLOS Genet . 3 (1): e8. doi :10.1371/journal.pgen.0030008 . PMC 1761047 . PMID 17206865 .
^ Joy T, Cao H, Black G, Malik R, Charlton-Menys V, Hegele RA, Durrington PN (2007). "Alstrom syndrome (OMIM 203800): a case report and literature review" . Orphanet Journal of Rare Diseases . 2 (1): 49. doi :10.1186/1750-1172-2-49 . PMC 2266715 . PMID 18154657 .
Šablon:Cilijarni proteini