Hromosom 6 | |
---|---|
Karakteristike | |
Dužina (bp) | 170,805,979 bp (GRCh38)[1] |
Br. gena | 996 (CCDS)[2] |
Vrsta | Autosom |
Pozicija centromere | Submetacentrik[3] (59.8 Mbp[4]) |
Kompletan spisak gena | |
CCDS | Spisak gena |
HGNC | Spisak gena |
UniProt | Spisak gena |
NCBI | Spisak gena |
Vanjski preglednici karata | |
Ensembl | Hromosom 6 |
Entrez | Hromosom 6 |
NCBI | Hromosom 6 |
UCSC | Hromosom 6 |
Potpune DNK sekvence | |
RefSeq | NC_000006 (FASTA) |
GenBank | CM000668 (FASTA) |
Hromosom 6 jedan je od 23 para hromosoma kod ljudi. Obično imaju dvije kopije ovog hromosoma. Hromosom 6 obuhvata više od 170 miliona baznih parova (građevnog materijal DNK) i predstavlja između 5,5 i 6% ukupne DNK u ćeliji. Sadrži glavni kompleks histokompatibilnosti, koji sadrži preko 100 gena povezanih sa imunskim odgovorom i ima vitalnu ulogu u transplantaciji organa.
Na hromosomu 6 nalaze se geni za sintezu antigena ljudskih leukocita, sa izuzetkom gena za β2-mikroglobulin (koji se nalazi na hromosomu 15) i kodira antigene ćelijske površine – predstavljajući proteine među ostalim funkcijama.
U 2003, čitav hromozom 6 ručno je označen za proteine, što je rezultiralo identifikacijom 1.557 gena i 633 pseudogena.[5]
Slijede neke od novijih procjena broja gena. Budući da istraživači koriste različite pristupe označavanju genoma, njihova predviđanja broja gena na svakom hromosomu variraju (za tehničke detalje pogledajte predviđanje gena). Među raznim projektima, zajednički Projekt konsenzusnog kodiranja (CCDS) zauzima izuzetno konzervativnu strategiju. Dakle, predviđanje broja gena CCDS predstavlja donju granicu ukupnog broja gena koji kodiraju ljudske proteine.[6]
Baza podataka | Protein-kodirajući geni | Nekodirajuči geni RNK | Pseudogeni | Izvor | Datum objave |
---|---|---|---|---|---|
996 | — | — | [2] | 2016-09-08 | |
1.007 | 422 | 736 | [7] | 2017-05-12 | |
1.038 | 985 | 800 | [8] | 2017-03-29 | |
1,111 | — | — | [9] | 2018-02-28 | |
1,053 | 1,188 | 911 | [10][11][12] | 2017-05-19 |
Slijedi djelimična lista gena na ljudskom hromosomu 6. Potpunu listu pogledajte u informacijskom okviru s desne strane.
Slijede neki od gena smještenih na (kraćem) p-kraku ljudskog hromosoma 6:
Slijede neki od gena smještenih na (dužem) q-kraku ljudskog hromosoma 6:
Hromosom | Kraci: p – kratki, q – dugi | Pruga/bend | ISCN start[19] |
ISCN stop[19] |
Bazni par start |
Bazni par stop |
Boja | Gustoća |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
6 | p | 25.3 | 0 | 118 | 1 | 2.300.000 | gneg | |
6 | p | 25.2 | 118 | 207 | 2.300.001 | 4.200.000 | gpos | 25 |
6 | p | 25.1 | 207 | 355 | 4.200.001 | 7.100.000 | gneg | |
6 | p | 24.3 | 355 | 548 | 7.100.001 | 10.600.000 | gpos | 50 |
6 | p | 24.2 | 548 | 592 | 10.600.001 | 11.600.000 | gneg | |
6 | p | 24.1 | 592 | 740 | 11.600.001 | 13.400.000 | gpos | 25 |
6 | p | 23 | 740 | 844 | 13.400.001 | 15.200.000 | gneg | |
6 | p | 22.3 | 844 | 1185 | 15.200.001 | 25.200.000 | gpos | 75 |
6 | p | 22.2 | 1185 | 1348 | 25.200.001 | 27.100.000 | gneg | |
6 | p | 22.1 | 1348 | 1585 | 27.100.001 | 30.500.000 | gpos | 50 |
6 | p | 21.33 | 1585 | 1718 | 30.500.001 | 32.100.000 | gneg | |
6 | p | 21.32 | 1718 | 1836 | 32.100.001 | 33.500.000 | gpos | 25 |
6 | p | 21.31 | 1836 | 2162 | 33.500.001 | 36.600.000 | gneg | |
6 | p | 21.2 | 2162 | 2310 | 36.600.001 | 40.500.000 | gpos | 25 |
6 | p | 21.1 | 2310 | 2755 | 40.500.001 | 46.200.000 | gneg | |
6 | p | 12.3 | 2755 | 3080 | 46.200.001 | 51.800.000 | gpos | 100 |
6 | p | 12.2 | 3080 | 3140 | 51.800.001 | 53.000.000 | gneg | |
6 | p | 12.1 | 3140 | 3377 | 1 5.300.000 | 57.200.000 | gpos | 100 |
6 | p | 11.2 | 3377 | 3421 | 57.200.001 | 58.500.000 | gneg | |
6 | p | 11.1 | 3421 | 3554 | 58.500.001 | 59.800.000 | acen | |
6 | q | 11.1 | 3554 | 3658 | 59.800.001 | 62.600.000 | acen | |
6 | q | 11.2 | 3658 | 3732 | 62.600.001 | 62.700.000 | gneg | |
6 | q | 12 | 3732 | 4147 | 62.700.001 | 69.200.000 | gpos | 100 |
6 | q | 13 | 4147 | 4324 | 69.200.001 | 75.200.000 | gneg | |
6 | q | 14.1 | 4324 | 4621 | 75.200.001 | 83.200.000 | gpos | 50 |
6 | q | 14.2 | 4621 | 4709 | 83.200.001 | 84.200.000 | gneg | |
6 | q | 14.3 | 4709 | 4917 | 84.200.001 | 87.300.000 | gpos | 50 |
6 | q | 15 | 4917 | 5228 | 87.300.001 | 92.500.000 | gneg | |
6 | q | 16.1 | 5228 | 5613 | 92.500.001 | 98.900.000 | gpos | 100 |
6 | q | 16.2 | 5613 | 5687 | 98.900.001 | 100.000.000 | gneg | |
6 | q | 16.3 | 5687 | 5983 | 1 10.000.000 | 105.000.000 | gpos | 100 |
6 | q | 21 | 5983 | 6531 | 1 10.500.000 | 114.200.000 | gneg | |
6 | q | 22.1 | 6531 | 6753 | 114.200.001 | 117.900.000 | gpos | 75 |
6 | q | 22.2 | 6753 | 6872 | 117.900.001 | 118.100.000 | gneg | |
6 | q | 22.31 | 6872 | 7168 | 118.100.001 | 125.800.000 | gpos | 100 |
6 | q | 22.32 | 7168 | 7345 | 125.800.001 | 126.800.000 | gneg | |
6 | q | 22.33 | 7345 | 7642 | 126.800.001 | 130.000.000 | gpos | 75 |
6 | q | 23.1 | 7642 | 7923 | 1 13.000.000 | 130.900.000 | gneg | |
6 | q | 23.2 | 7923 | 8145 | 130.900.001 | 134.700.000 | gpos | 50 |
6 | q | 23.3 | 8145 | 8352 | 134.700.001 | 138.300.000 | gneg | |
6 | q | 24.1 | 8352 | 8560 | 138.300.001 | 142.200.000 | gpos | 75 |
6 | q | 24.2 | 8560 | 8708 | 142.200.001 | 145.100.000 | gneg | |
6 | q | 24.3 | 8708 | 8886 | 145.100.001 | 148.500.000 | gpos | 75 |
6 | q | 25.1 | 8886 | 9078 | 148.500.001 | 152.100.000 | gneg | |
6 | q | 25.2 | 9078 | 9241 | 152.100.001 | 155.200.000 | gpos | 50 |
6 | q | 25.3 | 9241 | 9596 | 155.200.001 | 160.600.000 | gneg | |
6 | q | 26 | 9596 | 9774 | 160.600.001 | 164.100.000 | gpos | 50 |
6 | q | 27 | 9774 | 10100 | 164.100.001 | 170.805.979 | gneg |
|url=
(pomoć), 6. 10. 2017. Pristupljeno 24. 3. 2021.