PcrA
PcrA, što znači smanjena kopija plazmida je helikaza koja je originalno otkrivena na ekranu za hromosomski kodirane gene koji su zahvaćeni plazmidom kružna struktura se okreće ori replikaciji u Gram-pozitivnom patogenu Staphylococcus aureus.
Biološke funkcije
[uredi | uredi izvor]Genetičke i biohemijske studije pokazale su da je helikaza neophodna za replikaciju plazmida u krugu i popravku oštećenja DNK, uzrokovanih izlaganjem ultraljubičastom zračenju. On katalizuje odmotavanje dvolančane plazmidne DNK koja je bila urezana u izvoru replikacije proteinom inicijacije replikacije. Genetike i biohemijske studije su također pokazale da helikaza igra važnu ulogu u preživljavanju ćelija, regulacijom nivoa rekombinacije posredovane RecA u Gram-pozitivnim bakterijama.
Biohemijska svojstva
[uredi | uredi izvor]Helikaza je monomerna translokaza i koristi ATP za odmotavanje DNK. Poželjni [asupstrat (biohemija)[supstrati]] su jednolančana DNK koja sadrži 3' prepuste. Procesivnost PcrA je povećana u prisustvu proteina inicijacije replikacije plazmida.
Struktura helikaze je riješena u visokoj rezoluciji i ukazuje na "crvplikost" kao mehanizam translokacije na jednolančanu DNK. Predložen je model meksičkog talasa na osnovu promjena u konformaciji helikaze, uočenih u kompleksu proizvoda u odnosu na supstrat.
Klasifikacija
[uredi | uredi izvor]PcrA pripada natporodici SF1 helikaza, koje također uključuju E. coli helikaze UvrD i Rep i eukariotske helikaze Srs2.
Reference
[uredi | uredi izvor]- Iordanescu, S (Oct 1993). "Characterization of the Staphylococcus aureus chromosomal gene pcrA, identified by mutations affecting plasmid pT181 replication". Mol Gen Genet. 241 (1–2): 185–92. doi:10.1007/BF00280216. PMID 8232203. S2CID 685186.
- Petit, MA; Dervyn, E; Rose, M; Entian, KD; McGovern, S; Ehrlich, SD; Bruand, C (Jul 1998). "PcrA is an essential DNA helicase of Bacillus subtilis fulfilling functions both in repair and rolling-circle replication". Mol Microbiol. 29 (1): 261–73. doi:10.1046/j.1365-2958.1998.00927.x. PMID 9701819. S2CID 39193812.
- Petit, MA; Ehrlich, D (Jun 2002). "Essential bacterial helicases that counteract the toxicity of recombination proteins". EMBO J. 21 (12): 3137–47. doi:10.1093/emboj/cdf317. PMC 126070. PMID 12065426.
- Chang, TL; Naqvi, A; Anand, SP; Kramer, MG; Munshi, R; Khan, SA (Nov 2002). "Biochemical characterization of the Staphylococcus aureus PcrA helicase and its role in plasmid rolling circle replication". J Biol Chem. 277 (48): 45880–6. doi:10.1074/jbc.m207383200. PMID 12244110.
- Anand, SP; Zheng, H; Bianco, PR; Leuba, SH; Khan, SA (Jun 2007). "DNA helicase activity of PcrA is not required for the displacement of RecA protein from DNA or inhibition of RecA-mediated strand exchange". J Bacteriol. 189 (12): 4502–9. doi:10.1128/jb.00376-07. PMC 1913354. PMID 17449621.
- Soultanas, P; Dillingham, MS; Papadopoulos, F; Phillips, SE; Thomas, CD; Wigley, DB (Mar 1999). "Plasmid replication initiator protein RepD increases the processivity of PcrA DNA helicase". Nucleic Acids Res. 27 (6): 1421–8. doi:10.1093/nar/27.6.1421. PMC 148333. PMID 10037801.
- Velankar, SS; Soultanas, P; Dillingham, MS; Subramanya, HS; Wigley, DB (Apr 1999). "Crystal structures of complexes of PcrA DNA helicase with a DNA substrate indicate an inchworm mechanism". Cell. 97 (1): 75–84. doi:10.1016/s0092-8674(00)80716-3. PMID 10199404.