Adolf Naef estudià a la Universitat de Zúric sota la guia d'Arnold Lang (1855—1914), un amic íntim d'Ernst Haeckel. Naef treballà a la Stazione Zoologica de Nàpols el 1908, i estudià el calamar comú europeu Loligo vulgaris.[1][2] Naef tornà a Nàpols a mitjan dècada de 1930 per estudiar els cefalòpodes i publicà la monografia Fauna und Flora des Golfes von Neapel und der Angrenzenden Meers-Abschitte (Fauna e Flora del Golfo di Napoli),[3][4][5] which formed the basis for his two short but significant monographs on systematic theory.[6][7] L'any 1922 va esdevenir Professor a la Universitat de Zagreb, i el 1927 Professor de Zoologia a la Universitat del Caire.
Studien zur generellen Morphologie der Mollusken, Ergebnisse und Fortschritte der Zoologie, Teil 1, Band 3, 1911, 73-164, Teil 2, Band 3, 1913, 329-462, Teil 3, Band 6, 1924, 27-124
Idealistische Morphologie und Phylogenetik (zur Methodik der systematischen Morphologie), Jena: G. Fischer 1919
Die Cephalopoden, Fauna und Flora des Golf von Neapel und der angrenzenden Meeres-Abschnitte, Berlin: Friedländer 1921
Die Cephalopoden (Systematik), Fauna und Flora des Golf von Neapel und der angrenzenden Meeres-Abschnitte, Berlin: Friedländer 1923
Die Cephalopoden (Embryologie), Fauna und Flora des Golf von Neapel und der angrenzenden Meeres-Abschnitte, Berlin: Friedländer 1928
Die fossilen Tintenfische. Eine paläozoologische Monographie, Jena: Gustav Fischer 1922
Über Morphologie und Stammesgeschichte, Vierteljahresschrift der Naturforschenden Gesellschaft Zürich, 70, 1925, 234-240
Zur Diskussion des Homologiebegriffes und seiner Anwendung in der Morphologie, Biologisches Zentralblatt 46, 1926, 405–427.
Über die Urformen der Anthropomorphen und die Stammesgeschichte des Menschenschädels, Die Naturwissenschaften 14, 1926, 445–452.
Die Definition des Homologiebegriffes, Biologisches Zentralblatt 47, 1927, S. 187–190.
Phylogenie der Tiere, Handbuch der Vererbungswissenschaft, Band 3, Borntraeger 1931
Allgemeine Morphologie I, in L. Bolk u.a. Handbuch der vergleichenden Anatomie der Wirbeltiere, Band 1, Berlin 1931, 77-118
Physlogenie der Tiere, in Dittler u.a. Handwörterbuch der Naturwissenschaften, Band 7, 2. Auflage, G. Fischer 1932, 3-17
Die Vorstufen der Menschwerdung. Eine anschauliche Darstellung der menschlichen Stammesgeschichte und eine kritische Betrachtung ihrer allgemeinen Voraussetzungen., Jena: G. Fischer 1933
↑Naef, A. (1909a). Die Organogenese des Cölomsystems und der zentralen Blutgefässe von Loligo. Jenaische Zeitschrift für Naturwissenschaft, 45, N.F. 38:221—266.
↑Naef, A. (1909b). Die Organogenese des Cölomsystems und der zentralen Blutgefässe von Loligo. Inaugural-Dissertation, Univers. Zúric, 46pp.
↑Naef, A. (1972a). Cephalopoda. Fauna and Flora of the Bay of Naples (Fauna und Flora des Golfes von Neapel und der Angrenzenden Meers-Abschitte), Monograph 35, Part I, [Vol. I], Fascicle I. Smithsonian Institution Libraries, Washington.
↑Naef, A. (1972b). Cephalopoda (systematics). Fauna and Flora of the Bay of Naples (Fauna e Flora del Golfo di Napoli), Monograph 35, Part I, [Vol. I], Fascicle II. Washington, Smithsonian Institution Libraries.
↑Naef, A. (2000). Cephalopoda. Embryology. Fauna and Flora of the Bay of Naples [Fauna und Flora des Golfes von Naepel]. Monograph 35. Part I, Vol. II [Final part of the Monograph No. 35], pp. 3-461. Washington, Smithsonian.
↑Naef, A. (1917). Die individuelle Entwicklung organischer Formen als Urkunde ihrer Stammesgeschichte: (Kritische Betrachtungen über das sogenannte “biogenetische Grundgesetz”). Verlag von Gustav Fischer, Jena.
↑Naef, A. (1919). Idealistische Morphologie und Phylogenetik (zur Methodik der systematischen). Verlag von Gustav Fischer, Jena.
Rieppel Olivier «Adolf Naef (1883–1949), systematic morphology and phylogenetics». Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research, 50, 1, 2012, pàg. 2–13. DOI: 10.1111/j.1439-0469.2011.00635.x.