Comença a treballar en la selva amazònica com entomòleg per al Museo Paraense Emílio Goeldi mes, sota la influència dels botànics Jacques Huber (1867-1914) i de Paul Le Cointe (1870-?), s'orienta cap a l'estudi de la flora. Fa nombrosos viatges a l'Amazones on estudia l'estructura del sistema forestal. Publica 180 articles i monografies, principalment sobre les lleguminoses.
Ducke descriu 900 noves espècies i 50 nous gèneres de plantes. L'any 1918, a més del seu intens treball per al Museo Paraense, col·labora amb altres institucions com el Jardí botànic de Rio de Janeiro o l'Institut Agronómico del Norte. Durant la primera meitat del segle xx, va ser un dels més importants autoritats sobre la flora amazònica.
L'any 1954, pels seus raonaments sobre l'esdevenir de la selva amazònica, suggereix a l'Institut Nacional de Pesquisas de la Amazónia INPA, de crear reserves naturals. No va arribar a veure els seus esforços coronats abans de morir. L'any 1963, es crea la Reserva Florestal Adolpho Ducke. Igualment un jardí botànic a l'est de Manaus porta el seu nom.
Ducke, A. 1897. Aufzahlung der bei Triest im Jahr 1896 von mir gesammelten Osmia-Arten und Beschribung einer neuen Art. Ent. Nachr., 23, 38-43
Ducke, A. 1898. Zur Kentnis der Bienenfauna des österreichischen Kustenlandes. Ent. Nachr., 24, 212-217, 257-262
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Ducke, A. 1901. Beitrage zur Kenntnis der geographischen Verbreitung der Chrysididen und Beschreibung von drei neuen Arten. Zeitschr. Syst. Hymenopterol. Dipterol., 1, 353-361
Ducke, A. 1901. Beobachtungen über Blutenbesuch, Erscheinungszeit etc. der bei Pará vorkommenden Bienen. Zeitschr. Syst. Hymenopterol. Dipterol., 1, 25-32, 49-67
Ducke, A. 1901. Beobachtunger über Blutenbesuch, Erscheinungszeit etc. der bei Pará vorkommenden Bienen. Zeitschr. Syst. Hymenopterol. Dipterol., 1, 25-67
Ducke, A. 1901. Zur Kenntnis einiger Sphegiden von Pará (Hym.). Zeitschr. Syst. Hymenopterol. Dipterol., 1, 241-242
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Ducke, A. 1902. Ein neues Subgenus von Halictus Latr. Zeitschr. Syst. Hymenopterol. Dipterol., 2, 102-103
Ducke, A. 1902. Ein wenig bekanntes Chrysididengenus Amisega Cam. Zeitschr. Syst. Hymenopterol. Dipterol., 2, 141-144
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