GroEL

GroEL
Estructures disponibles PDB Cerca ortòloga: PDBe RCSB Llista de codis id de PDB 4PJ1
Identificadors
Àlies	HSPD1 (HUGO), CPN60, GROEL, HLD4, HSP-60, HSP60, HSP65, HuCHA60, SPG13, heat shock protein family D (Hsp60) member 1
Identif. externs	OMIM: 118190   MGI: 96242   HomoloGene: 1626   GeneCards: HSPD1   OMA: HSPD1 - orthologs
Malalties relacionades genèticament
hereditary spastic paraplegia 13 , hypomyelinating leukodystrophy 4  [1]
Localització del gen (humà) Cromosoma: 2 (humà)[2] Banda 2q33.1 Inici 197.486.584 bp[2] Fi 197.516.737 bp[2]
Localització del gen (ratolí) Cromosoma: 1 (ratolí)[3] Banda 1|1 C1.2 Inici 55.116.994 bp[3] Fi 55.127.402 bp[3]
Patró d'expressió d'ARN Bgee humà ratolí (ortòleg) Més explicacions right adrenal gland  right adrenal cortex  left adrenal gland  left adrenal cortex  ventricular zone  cos del pàncrees  epithelium of colon  mucosa of transverse colon  eminència ganglionar  recte Més explicacions tail of embryo  epiblast  ovari genital tubercle  glàndula suprarenal right kidney  túbul contort proximal embrió blastocist sac vitel·lí Més referències a dades d'expressió BioGPS Més referències a dades d'expressió
Ontologia genètica Funció molecular unió de nucleòtids  chaperone binding  p53 binding  single-stranded DNA binding  activitat ATPasa  unió proteica  double-stranded RNA binding  DNA replication origin binding  unió d'ATP  unió de la proteïna de la ubiquitina  protein folding chaperone activity  unfolded protein binding  RNA binding  activitat hidrolasa  high-density lipoprotein particle binding  enzyme binding  apolipoprotein binding  apolipoprotein A-I binding  lipopolysaccharide binding  isomerase activity  Component cel·lular citoplasma  cyclin-dependent protein kinase activating kinase holoenzyme complex  lipopolysaccharide receptor complex  early endosome  mitocondri  clathrin-coated pit  coated vesicle  exosoma extracel·lular  matriu extracel·lular  matriu mitocondrial  extracel·lular  mitochondrial inner membrane  citosol  membrana plasmàtica  superfície cel·lular  membrana  secretory granule  complex macromolecular  Procés biològic chaperone-mediated protein complex assembly  positive regulation of interleukin-12 production  positive regulation of interleukin-10 production  protein stabilization  protein maturation  positive regulation of macrophage activation  MyD88-dependent toll-like receptor signaling pathway  isotype switching to IgG isotypes  B cell activation  B cell cytokine production  response to unfolded protein  B cell proliferation  plegament proteic  positive regulation of T cell mediated immune response to tumor cell  protein refolding  positive regulation of interleukin-6 production  positive regulation of apoptotic process  response to cold  procés viral  activation of cysteine-type endopeptidase activity involved in apoptotic process  regulation of transcription by RNA polymerase II  'de novo' protein folding  protein import into mitochondrial intermembrane space  chaperone-mediated protein folding  apoptotic mitochondrial changes  positive regulation of interferon-alpha production  positive regulation of interferon-gamma production  T cell activation  negative regulation of apoptotic process  positive regulation of T cell activation  mitochondrion organization  Fonts: Amigo / QuickGO
Ortòlegs Espècies Humà Ratolí Entrez 3329 15510 Ensembl ENSG00000144381 ENSMUSG00000025980 UniProt P10809 P63038 RefSeq (ARNm) NM_002156 NM_199440 NM_010477 NM_001356512 RefSeq (proteïna) NP_002147 NP_955472 NP_034607 NP_001343441 Localització (UCSC) Chr 2: 197.49 – 197.52 Mb Chr 1: 55.12 – 55.13 Mb Cerca a PubMed [4] [5]
Wikidata
Veure/Editar gen humà Veure/Editar gen del ratolí

GroEL és una proteïna que pertany a la família de les xaperonines de les xaperones moleculars, i es troba en molts bacteris.^[6] És necessari per al correcte plegament de moltes proteïnes. Per funcionar correctament, GroEL requereix el complex de proteïnes de la coxaperonina, semblant a la tapa, GroES. En els eucariotes, les proteïnes d'orgànuls Hsp60 i Hsp10 són estructuralment i funcionalment gairebé idèntiques a GroEL i GroES, respectivament, a causa del seu origen endosimbiòtic.

Mecanisme

Dins de la cèl·lula, el procés de plegament de proteïnes mediades per GroEL / ES implica múltiples rondes d’unió, encapsulació i alliberament de proteïna del substrat. Les proteïnes del substrat desplegades s’uneixen a una regió d’unió hidròfoba a la vora interior de la cavitat oberta de GroEL, formant un complex binari amb la xaperonina. La unió de la proteïna del substrat d'aquesta manera, a més de la unió d' ATP, indueix un canvi conformacional que permet l'associació del complex binari amb una estructura de tapa separada, GroES. La unió de GroES a la cavitat oberta de la xaperonina indueix les subunitats individuals de la xaperonina a girar de manera que el lloc d'unió del substrat hidrofòbic s'elimini de l'interior de la cavitat, provocant que la proteïna del substrat s'expulsi de la vora a la cambra ara en gran part hidròfila. L'entorn hidrofílic de la cambra afavoreix l'ocultació de residus hidrofòbics del substrat, induint el plegament del substrat. La hidròlisi de l'ATP i la unió d'una nova proteïna de substrat a la cavitat oposada envia un senyal al·lostèric que provoca l'alliberament de GroES i la proteïna encapsulada al citosol. Una determinada proteïna experimentarà múltiples rondes de plegament, tornant cada vegada al seu estat original desplegat, fins que s'aconsegueixi la conformació nativa o una estructura intermèdia compromesa a assolir l'estat natiu. Com a alternativa, el substrat pot sucumbir a una reacció de la competència, com ara plegament erroni i agregació amb altres proteïnes mal plegades.^[7]

Estructura

Estructuralment, GroEL és un tetradecàmer de doble anell, amb els anells cis i trans que consten de set subunitats cadascun. Els canvis conformacionals que es produeixen a la cavitat central de GroEL fan que l’interior de GroEL es converteixi en hidròfil, en lloc d’hidrofòbic, i és probable que faciliti el plegament de les proteïnes.

• 
  GroEL (vista lateral)
• 
  GroEL (vista superior)
• 
  Complex GroES/GroEL (lateral)
• 
  Complex GroES/GroEL (superior)

Referències

1. «Malalties que s'associen genèticament amb GroEL, vegeu/editeu les referències a wikidata».
2. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000144381 - Ensembl, May 2017
3. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000025980 – Ensembl, May 2017
4. «Human PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
5. «Mouse PubMed Reference:». National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
6. «The universally conserved GroE (Hsp60) chaperonins». Annu. Rev. Microbiol., 45, 1991, pàg. 301–25. DOI: 10.1146/annurev.mi.45.100191.001505. PMID: 1683763.
7. «Dues famílies de xaperonina: fisiologia i mecanisme». Annu. Rev. Cell Dev. Biol., 23, 2007, pàg. 115-45. DOI: 10.1146 / annurev.cellbio.23.090506.123555. PMID: 17489689.