Intelligent Systems Co., Ltd. (株式会社インテリジェントシステムズ, Kabushiki-Gaisha Interijento Shisutemuzu) és una desenvolupadora de videojocs interna de Nintendo. Intelligent Systems es forma amb membres eixits del Nintendo R&D1 per a crear la seua pròpia desenvolupadora. Des dels seus inicis, mantenen una estreta relació amb Nintendo, i més exactament amb Gunpei Yokoi, director del R&D1, amb el qual treballen braç a braç en molts dels seus jocs, fent difícil saber quins jocs han estat desenvolupats per Intelligent Systems i quals pel R&D1. Al llarg dels anys, aquesta desenvolupadora ha creat grans franquícies per a la marca Nintendo com poden ser Metroid, Paper Mario, WarioWare, Advance Wars o Fire Emblem. Però no només crea videojocs, sinó que a més al llarg d'aquests anys ha creat diferents eines per a la programació en totes les consoles Nintendo, a més de productes com el Super Game Boy o el Game Boy Player.