Dorothy Garrod va estudiar la transició cultural del mesolític al neolític representada en la cova de Shuqba al nord de Wadi an-Natuf, prop de Shuqba el 1928. El nom "natufià "va ser encunyat per descriure els habitants del Llevant meridional en aquest moment crucial de la història de la humanitat.[3]
S'hi ha trobat terrissa del primer període otomà.[4] En 1596 Shuqba formava part de la nàhiya o subdistricte de Ramla, que estava sota l'administració del liwà o districte de Gaza. Als registres fiscals d'aquest any tenia 49 famílies que eren totes musulmans. Pagaven una taxa impositiva fixa del 25% sobre productes agrícoles, inclosos blat, ordi, cultius d'estiu, oliveres, cabres i ruscs, a més d'ingressos ocasionals i una premsa per a olives o xarops de raïm; un total de 2.600 akçe.[5]
Sota el nom de Schakba es va trobar a una llista de viles otomanes del 1870 en la qual tenia 39 cases i una població de 141, tot i que el recompte de població només incloïa homes. Es va assenyalar que estava situat al nord de Deir Qaddis i a l'oest de Bayt Nabala.[6][7]
En 1882 el Survey of Western Palestine de la Palestine Exploration Fund la descrivia com «una petita vila a la zona alta, envoltada d'arbres.»[8]
En 1945 la població era de 840 musulmans,[11] mentre que l'àrea total de terra era de 15,013 dúnams, segons una enquesta oficial de terra i població.[12] D'aquests, 1,496 eren plantacions i terra de rec, 5,053 per a cereals,[13] mentre 16 dúnams eren sòl edificat.[14]