Euryarchaeota

Euryarchaeota
Halobacterium
Vědecká klasifikace
Doména	archea (Archaea)
Říše	Methanobacteriati
Kmen	Euryarchaeota Garrity and Holt 2002[1]
Třídy
viz text
Synonyma
Methanobacteriota Garrity and Holt 2023[1]
Některá data mohou pocházet z datové položky.

Euryarchaeota je velká skupina archeí, poprvé popsaná jako říše Woesem, Kandlerem a Wheelisem roku 1990 v rámci vzniku nové domény Archaea.^{[2][pozn. 1]} V současnosti (r. 2024) po doplnění o nově objevené příbuzné linie archeí, je buďto opět povýšena na říši Methanobacteriati, nebo je pod novým platným jménem Methanobacteriota považována za jeden z jejích kmenů.^[4][5]

Název (eury) odkazuje na rozmanitost prostředí, v nichž žijí archea řazená do tohoto kmene,^[6] a na různorodost jejich metabolických drah. Euryarchaeota jsou definována svým speciálním typem archeálních ribozomů.^[2] Právě na základě genů pro rRNA malé ribozomální podjednotky jsou tato archea jednoznačně určena.

Do Euryarchaeota patří pestré spektrum organismů. Významní jsou metanogeni, kteří produkují metan a mohou se vyskytovat v různých prostředích včetně střev, dále halobakterie (též Haloarchaea), které jsou schopné žít ve vysokých koncentracích solí (halofilové), a také někteří extrémně termofilní aerobové a anaerobové.

Buňky euryarchaeot mohou mít rozmanitý tvar, nejen koky a tyčinky, ale též různé nepravidelné koule, spirily, buňky ve tvaru lancetové břitvy nebo disku, trojúhelníky či čtverce. Mohou se barvit grampozitivně i gramnegativně.^[6]

Systém

Taxonomie Národního střediska pro biotechnologické informace (NCBI)^[7], taxonomické ranky dle LPSN^[4]:^{[pozn. 2]}

Říše: Methanobacteriati (Garrity and Holt 2023) Oren and Göker 2024 (= Euryarchaeida Luketa 2012)

• Kmen: Halobacteriota** Chuvochina et al. 2024

  • Třída: Methanosarcinia Chuvochina et al. 2024 (= Methanocellia*** Chuvochina et al. 2024)
    • Řád: Methanocellales Sakai et al. 2008
    • Řád: Methanosarcinales Boone et al. 2002 (= Halomebacteria Cavalier-Smith 1986; = Methanotrichales***** Akinyemi et al. 2021)

• Kmen: Methanobacteriota Garrity and Holt 2023 (= Euryarchaeota Garrity and Holt 2002)

  • Třída: Archaeoglobi Garrity and Holt 2002
    • Řád: Archaeoglobales Huber and Stetter 2002
    • Řád: Candidatus Mnemosynellales* Adam et al. 2022
  • Třída: Candidatus Methanoliparia* Borrel et al. 2019
    • Řád: Candidatus Methanoliparales* Borrel et al. 2019
  • Třída: Methanonatronarchaeia Sorokin et al. 2018
    • Řád: Methanonatronarchaeales Sorokin et al. 2018
  • Třída: Candidatus Ordosarchaeia*** Zhao et al. 2024
    • Řád: Candidatus Ordosarchaeales*** Zhao et al. 2024
  • Třída: Candidatus Theionarchaea Lazar et al. 2017
  • Třída: Thermococci Zillig and Reysenbach 2002 (= Protoarchaea Cavalier-Smith 2002)
    • Řád: Thermococcales Zillig et al. 1988

  • skupina Methanomada
    • Třída: Methanobacteria Boone 2002 (= Archaeobacteria Murray 1988)
      • Řád: Methanobacteriales Balch and Wolfe 1981
    • Třída: Methanococci Boone 2002 (= Methanothermea Cavalier-Smith 2002)
      • Řád: Methanococcales Balch and Wolfe 1981
    • Třída: Methanopyri Garrity and Holt 2002
      • Řád: Methanopyrales Huber and Stetter 2002
  • skupina Stenosarchaea
    • Třída: Candidatus Methanofastidiosia* Nobu et al. 2016
      • Řád: Candidatus Methanofastidiosales* Rinke et al. 2021
    • Třída: Candidatus Nanohaloarchaea* Narasingarao et al. 2012 (= Candidatus Nanosalinia Rinke et al. 2021)
    • Třída: Halobacteria Grant et al. 2002
      • Řád: Halobacteriales Grant and Larsen 1989 (= Haloarchaeales DasSarma and DasSarma 2008; = Haloferacales Gupta et al. 2015; = Natrialbales Gupta et al. 2015)
      • Řád: Halorutilales Durán-Viseras et al. 2023
    • Třída: Methanomicrobia* Garrity et al. 2005
      • Řád: Candidatus Alkanophagales* Wang et al. 2021
      • Řád: Methanomicrobiales Balch and Wolfe 1981
      • Řád: Candidatus Methanophagales Borrel et al. 2019
      • Řád: Methanotrichales***** Akinyemi et al. 2021
  • Methanobacteriota incertae sedis

    • Řád: Candidatus Proteinoplasmatales**** Yin et al. 2022

• Kmen: Thermoplasmatota** Chuvochina et al. 2024

  • Řád: Candidatus Lutacidiplasmatales**** Sheridan et al. 2022
  • Řád: Candidatus Yaplasmales Zheng et al. 2022 (= Candidatus Detorarchales Pallen and Alikhan 2021)

  • Třída: Candidatus Poseidoniia* Rinke et al. 2019 (= Candidatus Thalassarchaeia Martin-Cuadrado et al. 2015)
    • Candidatus Poseidoniales* Rinke et al. 2019
  • Třída: Thermoplasmata Reysenbach 2002
    • Řád: Candidatus Aciduliprofundales*** Rinke et al. 2021
    • Řád: Candidatus Gimiplasmatales* Hu et al. 2021
    • Řád: Candidatus Halarchaeoplasmatales**** Zhou et al. 2022
    • Řád: Candidatus Lunaplasmatales*** Zinke et al. 2021
    • Řád: Candidatus Sysuiplasmatales**** Yuan et al. 2021
    • Řád: Candidatus Thermoprofundales* Zhou et al. 2019
    • Řád: Methanomassiliicoccales Iino et al. 2013 (= Methanoplasmatales Paul et al. 2012)
    • Řád: Thermoplasmatales Reysenbach 2002

Odkazy

Poznámky

1. Validačními seznamy v časopisech International Journal of Systematic Bacteriology a International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology byl uznán až popis Cavaliera-Smithe z r. 2002, který Euryarchaeota klasifikoval jako pododdělení.^[3]
2. * označuje jména, která nesplňují kritéria pro platnou publikaci v souladu s ICNP;
   ** označuje kmeny, které NCBI považuje za samostatné, LPSN za synonyma k Methanobacteriota;
   *** označuje jména uvedená pouze v LPSN;
   **** označuje jména uvedená pouze v NCBI;
   ***** řád Methanotrichales považuje NCBI za součást třídy Methanomicrobia, LPSN za synonymum k řádu Methanosarcinales třídy Methanosarcinia

Reference

V tomto článku byl použit překlad textu z článku Euryarchaeota na anglické Wikipedii.

1. [ https://www.ncbi.nlm.nih.gov/Taxonomy/Browser/wwwtax.cgi?mode=Info&id=28890&lvl=4&lin=f&keep=1&srchmode=1&unlock NCBI Taxonomy browser: Methanobacteriota]
2. Woese CR, Kandler O, Wheelis ML. Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya. Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.. 1990, roč. 87, čís. 12, s. 4576–9. Dostupné online. DOI 10.1073/pnas.87.12.4576. PMID 2112744. 
3. CAVALIER-SMITH, Thomas. The neomuran origin of archaebacteria, the negibacterial root of the universal tree and bacterial megaclassification. S. 7–76. International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology [online]. Microbiology Society, 1. leden 2002. Svazek 52, čís. 1, s. 7–76. Dostupné online. PDF [1]. ISSN 1466-5034. DOI 10.1099/00207713-52-1-7. (anglicky) 
4. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. Kingdom Methanobacteriati [cit. 2024-10-22]. Dostupné online (anglicky)
5. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature. Phylum Methanobacteriota [cit. 2024-10-22]. Dostupné online (anglicky)
6. KINGDOM EURYARCHAEOTA Dostupný online Archivováno 1. 9. 2006 na Wayback Machine.
7. NCBI Taxonomy browser: Methanobacteriati. Dostupné online (anglicky)

Externí odkazy

Identifikátory taxonu	Wikidata: Q204219 Wikidruhy: Euryarchaeota BioLib: 163390 EoL: 7921 EPPO: 1EURYP Fossilworks: 288518 GBIF: 24 iNaturalist: 151825 IRMNG: 160 ITIS: 951423 LPSN: euryarchaeota NCBI: 28890 WoRMS: 416226