Vlajka Karačajsko-Čerkeska, jedné z autonomních republik Ruské federace, je tvořena listem o poměru stran 1:2 se třemi vodorovnými pruhy: (světle)modrým, zeleným a červeným. Uprostřed, v zeleném pruhu, je umístěn úzký bílý prstenec (o průměru ⅓ šířky vlajky), v něm modré kruhové pole s bílou siluetou hory, za níž vychází žluté slunce se 16 paprsky – šest je úzkých a mezi nimi 5 zdvojených a širších.[1] Barvy emblému se v různých zdrojích liší:
Modrá barva na vlajce symbolizuje mír, klid, jasné a dobré pohnutky; zelená přírodu, plodnost, bohatství, mládí a moudrost; červená teplo a duchovní blízkost mezi národy. Tři pruhy představují i hlavní etnické skupiny:[1]
Hora představuje dvojklaný vrchol Elbrusu,[1] nejvyšší hory Ruské federace (nacházející se na hranici Karačajsko-Čerkeska a Kabardsko-Balkarska)
Po Říjnové revoluci a vítězství sovětské moci byla roku 1922 zřízena Karačajsko-čerkeská autonomní oblast, která byla roku 1926 rozdělena na Karačajskou AO a Čerkeský národní okruh (od roku 1928 Čerkeskou AO). V období II. světové války (v letech 1942–1943) bylo území načas okupováno nacistickým Německem a po jeho osvobození byli Karačajové obviněni z kolaborace s Němci a násilně přesídleni do Střední Asie a jejich autonomní oblast byla zrušena. K revizi tohoto aktu došlo roku 1957 a karačajskému obyvatelstvu byl povolen návrat. Současně byla znovu vytvořena Karačajsko-čerkeská autonomní oblast v rámci Stavropolského kraje.
30. listopadu 1990 se konalo zasedání Karačajsko-čerkeské oblastní rady lidových poslanců, které vyhlásilo Karačajsko-čerkeskou SSR. 3. července 1991 tuto změnu schválil zákon RSFSR. Republika se tak stala autonomní republikou v rámci Ruské federace. Užívala se vlajka RSFSR z roku 1954 (až do 22. srpna 1991). Poté ji nahradila vlajka Ruské federace.[1]
16. října 1992 byla republika přejmenována na Karačajsko-Čerkeskou republiku.
3. února 1994 přijala Nejvyšší rada Karačajsko-Čerkeska usnesení č. 76-XXI o státní vlajce. Autorem vlajky byl Nazir Kušchov. Podobu vlajky zřejmě ovlivnila i vlajka karačajsko-čerkeské organizace Tjora.[1]
Vlajka karačajsko-čerkeského prezidenta je tvořena listem o poměru stran 1:1 se třemi vodorovnými pruhy: (světle)modrým, zeleným a červeným. Uprostřed vlajky je umístěn státní znak (přes všechny pruhy). Vlajka byla schválena dekretem prezidenta Karačajsko-Čerkeské republiky č. 128 ze dne 4. listopadu 2002.[4]
Karačajsko-Čerkesko se člení na 2 městské okruhy a 10 rajónů. Není jasné, zda všechny subjekty užívají vlastní vlajku.