Sein Spezialgebiet war die Geschichte des antiken Griechenlands und dabei besonders die Militärgeschichte. Kagan verfasste unter anderem eine vierbändige Geschichte des Peloponnesischen Krieges, die als Standardwerk gilt. 2003 gab er eine Zusammenfassung des Werks für ein breiteres Publikum heraus.
Daneben trat Kagan auch politisch in Erscheinung. Einer seiner Söhne ist Robert Kagan, einer der führenden Köpfe der Neokonservativen in den USA, deren politische Vorstellungen auch Donald Kagan vertrat, obwohl er bis in die 1970er Jahre eher linksliberal eingestellt war. Mit seinem Sohn Frederick Kagan publizierte Donald Kagan 2000 das Buch While America sleeps, in dem beide für einen höheren Verteidigungsetat eintraten.
Donald Kagan starb im August 2021 im Alter von 89 Jahren.
The Great Dialogue. A History of Greek Political Thought from Homer to Polybius. Greenwood Press, Westport, Conn. 1986, ISBN 0-313-22380-7 (Nachdr. d. Ausg. New York 1965).
The Archidamian War. Cornell University Press, Ithaca, N.Y. 1991, ISBN 0-8014-0889-X (Nachdr. d. Ausg. New York 1974).
The Peace of Nicias and the Sicilian Expedition. Cornell University Press, Ithaca, N.Y. 1990, ISBN 0-8014-1367-2 (Nachdr. d. Ausg. New York 1981).
The Fall of the Athenian Empire. Cornell University Press, Ithaca, N.Y. 1990, ISBN 0-8014-1935-2 (Nachdr. d. Ausg. New York 1987).
Pericles of Athens and the Birth of Democracy. Touchstone Books, New York 1992, ISBN 0-671-74926-9 (Nachdr. d. Ausg. New York 1991).
Perikles. Die Geburt der Demokratie. Klett-Cotta, Stuttgart 1992, ISBN 3-608-93165-1.
On the Origins of War and the Preservation of Peace. Pimlico Books, London 1997, ISBN 0-7126-7350-4 (Nachdr. D. Ausg. New York 1995).
While America Sleeps. Self-Delusion, military weakness, and threat to peace today. St. Martin’s Press, New York 2000, ISBN 0-312-20624-0 (zusammen mit Frederick Kagan).
The Western Heritage. The western civilization. Pearson Prentice Hall, Upper Saddle River, N.J. 2007, ISBN 978-0-13-195068-9 (Nachdr. d. Ausg. New York 2003, zusammen mit Steven Ozment und Frank M. Turner).
Charles D. Hamilton (Hrsg.): Polis and Polemos. Essays on politics, war, and history in ancient Greece; in honor of Donald Kagan. Regina Books, Claremont, Calif. 1997, ISBN 0-941690-76-8.
Uwe Walter: Perikles als Erzieher, in: Frankfurter Allgemeine Zeitung, 17. August 2021, Seite 11.