Die Kunstakademie führt ihre Gründung auf die 1793 eröffnete Architekturfakultät der Universität Vilnius zurück. Bis 1832 wurden sukzessive Abteilungen für das gesamte Spektrum der Bildende Kunst aufgebaut: Malerei und Zeichnen (1797), Skulptur und Kunstgeschichte (1803), Gravur und Grafik (1805).
1940 wurde die Akademie aus der Universität ausgegliedert. Während der deutschen Besetzung Litauens geschlossen, wurde sie 1944 wiedereröffnet.
Die Kunstakademie Vilnius spielte und spielt eine bedeutende Rolle für die Denkmalpflege in Litauen.
Die Sammlung der Kunstakademie Vilnius wird vom 1994 in seiner heutigen Form gegründeten Akademiemuseum betreut und umfasst über 20.000 Inventarnummern. Das Museum betreut auch die Ausstellungshalle Titanikas, die Studierende, Absolventen und Lehrkräften sowie ausländischen Künstlern für Ausstellunge, Workshops und Konferenzen zur Verfügung steht.
Arūnas Gelūnas (* 1968), litauischer Museumsdirektor, Philosoph, Maler, Grafiker und Diplomat, Politiker, Kulturminister, Seimas-Mitglied
Paulius Kulikauskas (* 1964), litauischer Politiker, Vizeminister, Architekt, Urbanist und Diplomat
Povilas Mačiulis (* 1986), litauischer Politiker, Vizebürgermeister von Kaunas
Valentinas Mazuronis (* 1953), litauischer Architekt und Politiker, Parteivorsitzende von Darbo partija (leiboristai), Mitglied im Europaparlament, Mitglied des Seimas und Umweltminister
Radvilė Morkūnaitė-Mikulėnienė (* 1984), litauische Politikerin, Europarlamentarin und Seimas-Parlamentsvizepräsidentin, Ministerin für Bildung, Wissenschaft und Sport
Patricija Poderytė (* 1961), litauische Musikerin und Politikerin, Vizeministerin der Kultur
Josef Statkus (* 1968), litauischer Modedesigner, Kostümbildner für Mode und Theater
Arūnė Stirblytė (* 1968), litauische Politikerin, Mitglied im Seimas
Daina Urbanavičienė (* 1976), litauische Kulturmanagerin und Politikerin, Vizeministerin der Kultur
Gintautė Žemaitytė (* 1973), litauische Kunstpädagogin und Politikerin, Vizeministerin der Kultur