Der Ort liegt wegen seiner Lage westlich der Stadt Pontivy nahe an Straßen für den überregionalen Verkehr. Nördlich von Malguénac führt die D782 von Pontivy nach Rosporden vorbei. Die wichtigsten Straßenverbindungen sind die D700/D768 (ehemals Route nationale 168), die mehrere Kilometer östlich der Gemeinde vorbeiführt, die N164 im Norden und die N24 weiter im Süden.
Die bedeutendsten Gewässer sind die Bäche Bonne Chère, Le Frétu, Germaude, La Pierre und Ker Jéhanno. Diese bilden auch teilweise die Gemeindegrenze. Zudem gibt es mehrere Teiche auf dem Gemeindegebiet.
Die Gemeinde gehört historisch zur bretonischen Region Bro Gwened (frz. Vannetais) und innerhalb dieser Region zum Gebiet Bro Pondi (frz. Pays de Pontivy) und teilt dessen Geschichte. Seit 1793 gehört Malguénac zum Kanton Cléguérec. Teile der damaligen Gemeinde wurden bei der Bildung der neuen Gemeinde Le Sourn 1869 von Malguénac abgetrennt.[3]