Nachdem sie bei Google und Toshiba gearbeitet hatte, schloss sich Zatlyn dem Startup I Love Rewards (später Achievers), einem globalen Mitarbeiterbelohnungsprogramm, an.[7][8]
Im Jahr 2009 gründete Zatlyn zusammen mit ihren Kommilitonen Matthew Prince und Lee Holloway von der Harvard Business School das Unternehmen Cloudflare.[3][9] Sie sitzt im Vorstand von Cloudflare und ist Präsident und COO des Unternehmens.[1][10]
Über die Mitbegründung von Cloudflare sagte sie:
„When we came up with Cloudflare, I knew nothing about internet security, but I care a lot about liking what I’m doing. I knew if I could help create internet security, that’s something I could work hard for and be proud; 10 years later, we have 165 data centres, 12 million domains and more than 800 employees.“ (zu deutsch; „Als wir Cloudflare gründeten, wusste ich nichts über Internetsicherheit, aber mir liegt sehr viel daran, dass ich das, was ich tue, mag. Ich wusste, wenn ich dabei helfen könnte, Internetsicherheit zu schaffen, wäre das etwas, für das ich hart arbeiten und auf das ich stolz sein könnte. 10 Jahre später haben wir 165 Rechenzentren, 12 Millionen Domains und mehr als 800 Mitarbeiter.“)[11]