Natriumborat-Puffer

Natriumborat-Puffer (SB-Puffer) ist ein Elektrophoresepuffer, der in der Biochemie und Molekularbiologie im Zuge einer Agarose-Gelelektrophorese zur Trennung von Nukleinsäuren wie DNA oder RNA verwendet wird.^[1][2][3]

Eigenschaften

Der SB-Puffer ist aus Natriumhydroxid und Borsäure zusammengesetzt (1–10 mM, pH 8.0) und besitzt im Vergleich zu den alternativen Puffern (TAE-Puffer, TBE-Puffer, TPE-Puffer) eine niedrigere Ionenstärke und daher eine niedrigere elektrische Leitfähigkeit, übertroffen nur durch den Lithiumborat-Puffer. Dies erlaubt eine höhere angelegte elektrische Spannung (5–35 V/cm Gellänge gegenüber 5–10 V/cm) und daher eine höhere Wanderungsgeschwindigkeit der Nukleinsäuren ohne Erhitzung des Agarosegels. Dadurch verkürzt sich die zur elektrophoretischen Trennung benötigte Zeit.

Weblinks

• Natriumborat als Elektrophoresepuffer

Einzelnachweise

1. Jonathan R. Brody, Scott E. Kern: Sodium boric acid: a tris-free, cooler conductive medium for DNA electrophoresis. In: BioTechniques. Bd. 36, Nr. 2, 2004, ISSN 0736-6205, S. 214–215, PMID 14989083 (PDF; 155 kB) (Memento vom 24. Juli 2011 im Internet Archive).
2. Jonathan R. Brody, Eric S. Calhoun, Eike Gallmeier, Talisa D. Creavalle, Scott E. Kern (2004): Ultra-fast high-resolution agarose electrophoresis of DNA and RNA using low-molarity conductive media. (Memento vom 14. August 2017 im Internet Archive) In: BioTechniques. Bd. 37, Nr. 4, 2004, S. 598–602, PMID 15517972 (PDF; 198 kB)@1@2Vorlage:Toter Link/www.biotechniques.com (Seite nicht mehr abrufbar, festgestellt im Mai 2019. Suche in Webarchiven).
3. Jonathan R. Brody, Scott E. Kern: History and principles of conductive media for standard DNA electrophoresis. In: Analytical Biochemistry. Bd. 333, Nr. 1, 2004, S. 1–13, PMID 15351274 (PDF; 1,14 MB).