Rauchvirus

Rauchvirus
Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Duplodnaviria[2]
Reich: Heunggongvirae[2]
Phylum: Uroviricota[2]
Klasse: Caudoviricetes[1]
Ordnung: incertae sedis
Familie: incertae sedis
Gattung: Rauchvirus
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: ikosaedrisch, tailed
(Podoviren)
Hülle: keine
Wissenschaftlicher Name
Rauchvirus
Links
ICTV Taxon History: 201900626
NCBI Taxonomy: 542959
ViralZone (Expasy, SIB): 705

Rauchvirus (veraltet: Bpp1virus, Bppunalikevirus, BPP-1-ähnliche Viren, englisch BPP-1-like viruses) ist eine Gattung von Viren im Realm Duplodnaviria, Klasse Caudoviricetes, Morphotyp Podoviren. Als natürliche Wirte dienen Bakterien. Die Gattung enthält derzeit (Stand Januar 2021) nur eine vom International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV) anerkannte Art (Spezies), d. h. sie ist monotypisch. Diese Spezies ist Bordetella-Virus BPP1 (daher auch Typusart).[3][2] Es gibt jedoch weitere vorgeschlagene Spezies der Gattung, siehe Systematik.

Aufbau

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Schemazeichnung eines Virions der Spezies Bordetella-Virus BPP1, Querschnitt und Seitenansicht

Die Virusteilchen (Virionen) in der Gattung Rauchvirus sind unbehüllt und als Mitglieder der Ordnung Caudovirales mit Kopf-Schwanz-Aufbau. Der Kopf hat ikosaedrische Geometrie mit und Symmetrie mit Symmetrie T=7.[4] Der Durchmesser beträgt etwa 67 nm. Das Genom besteht aus dsDNA, ist unsegmentiert (monopartit), linear und etwa 42 kbp (Kilo-Basenpaare) lang. Es kodiert üblicherweise für etwa 50 Proteine. Die Bordetella-Phagen dieser Gattung enthalten eine RNA-abhängige DNA-Polymerasen, die eine Rolle beim Tropismus spielt.[3][5][6]

Replikationszyklus

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Der Eintritt in die Wirtszelle erfolgt durch Injektion der dsDNA durch den Schwanz in die Wirtszelle. Die Virusreplikation erfolgt im Zytoplasma. Die Transkription erfolgt per DNA-Template. Die Freisetzung erfolgt durch Lyse. Die natürlichen Wirte sind Bakterien, die Übertragung geschieht durch passive Diffusion.[3]

Systematik

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Die Systematik der Gattung Rauchvirus ist mit Stand Mai 2024 mit der einzigen vom ICTV offiziell bestätigten Spezies[7][8] und weiteren Vorschlägen nach NCBI (Stand 10. Juli 2024)[9] wie folgt:

Realm: Duplodnaviria, Reich: Heunggongvirae, Klasse: Caudoviricetes, Morphotyp: Podoviren

  • Gattung: Rauchvirus (veraltet: Bpp1virus, Bppunalikevirus, BPP-1-ähnliche Viren, BPP-1-like viruses)
  • Spezies: Rauchvirus BPP1 (Bordetella-Virus BPP1), mit
    • Bordetella-Phage BIP-1
    • Bordetella-Phage BMP-1
    • Bordetella-Phage BPP-1 (Referenz oder „Exemplar“)
  • Spezies: „Rauchvirus SR18“ (en. „Caulobacter phage SR18“, „Caulobacter-Virus SR18“, Vorschlag) mit
    • „Caulobacter bacteriophage SR18“[10]
  • Spezies: „Caulobacter-Phage BL94“ (en.: „Caulobacter phage BL94“, Vorschlag)
  • Spezies: „Caulobacter-Phage Jess A“ (en.: „Caulobacter phage Jess A“, Vorschlag)[10]
  • Spezies: „Caulobacter-Phage RapA4“ (en.: „Caulobacter phage RapA“, Vorschlag)

Folgende früheren Vorschläge sind aktuell nicht mehr der Gattung Rauchvirus zugeordnet:

  • Spezies: Burkholderia-Virus BcepC6B (wiss. Ryyoungvirus bcepC6B)
  • aktuell ohne Gattungszuordnung
  • Spezies: „Caulobacte-Phage RW“ (en.: „Caulobacter phage RW“, Vorschlag)[10]

Einzelnachweise

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  1. ↑ ICTV: ICTV Master Species List 2021.v2, New MSL including some corrections.
  2. ↑ a b c d ICTV: ICTV Master Species List 2019.v1, New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  3. ↑ a b c SIB: Rauchvirus. In: ViralZone. ExPASy, abgerufen am 22. Januar 2021.
  4. ↑ SIB: T=7 icosahedral capsid protein, auf: ViralZone ExPASy. Abgerufen am 22. Januar 2021
  5. ↑ W. Dai, A. Hodes, W. H. Hui, M. Gingery, J. F. Miller, Z. H. Zhou: Three-dimensional structure of tropism-switching Bordetella bacteriophage. In: Proceedings of the National Academy of Sciences. 107. Jahrgang, Nr. 9, 2010, S. 4347–4352, doi:10.1073/pnas.0915008107, PMID 20160083, PMC 2840154 (freier Volltext), bibcode:2010PNAS..107.4347D.
  6. ↑ M. Liu, M. Gingery, S. R. Doulatov, Y. Liu, A. Hodes, S. Baker, P. Davis, M. Simmonds, C. Churcher, K. Mungall, M. A. Quail, A. Preston, E. T. Harvill, D. J. Maskell, F. A. Eiserling, J. Parkhill, J. F. Miller: Genomic and genetic analysis of Bordetella bacteriophages encoding reverse transcriptase-mediated tropism-switching cassettes. In: Journal of Bacteriology. 186. Jahrgang, Nr. 5, 2004, S. 1503–1517, doi:10.1128/JB.186.5.1503-1517.2004, PMID 14973019, PMC 344406 (freier Volltext).
  7. ↑ ICTV: Taxonomy Browser.
  8. ↑ ICTV: Virus Metadata Resource (VMR).
  9. ↑ NCBI: Rauchvirus (genus)
  10. ↑ a b c Bert Ely et al.: Novel Caulobacter bacteriophages illustrate the diversity of the podovirus genus Rauchvirus, in: Archives of Virology, Band 165, S. 2549–2554, 1. September 2020, doi:10.1007/s00705-020-04791-4