Pratt entstammte der Gentry aus Norfolk. Auf ausgedehnten Reisen und während eines Aufenthalts in Rom lernte er die damalige europäische Architektur kennen und arbeitete nach der Restauration als Kavaliersarchitekt. Er gilt als einer der Wegbereiter des Palladianismus in England, auch wenn von ihm nur wenige Bauten bekannt sind, die nicht oder nur stark verändert erhalten geblieben sind.
1666 wurde er von Karl II. zu einem der drei königlichen Kommissare ernannt, die Vorschriften für den Wiederaufbau Londons nach dem Großen Brand erstellen sollten. 1668 wurde er als erster englischer Architekt als Knight Bachelor in den Adelsstand erhoben und zog sich auf seinen Familiensitz Ryston Hall zurück.
The Architectur of Sir Roger Pratt. Charles II’s Commissioner for the Rebuilding of London After the Great Fire: Now Printed for the First Time from His Note-books. Arno Press, New York 1972 (Reprint der Ausgabe von 1924), ISBN 0-405-08862-0