TAE-Puffer ist die Abkürzung für TRIS-Acetat-EDTA-Puffer, ein nach seinen Bestandteilen
benannter Elektrophoresepuffer.[1] TAE-Puffer werden u. a. bei der Agarose-Gelelektrophorese zur Trennung von Nukleinsäuren eingesetzt. Die Konzentrationen für Tris und Essigsäure liegen meistens zwischen 40 und 50 millimolar.[2][3][4] Die EDTA-Konzentration liegt bei 1 mM. Der pH-Wert wird meistens auf 8 eingestellt.[2][3][4]
Alternativ verwendete Puffer zur Trennung von Nukleinsäuren sind z. B. TBE-Puffer, TPE-Puffer, SB-Puffer oder LB-Puffer. Im Vergleich zu TBE- und TPE-Puffern wird TAE-Puffer weniger während der Elektrophorese erhitzt, wodurch höhere Spannungen an das Gel angelegt werden können.[5] Jedoch besitzt es eine geringere Pufferkapazität als ein TBE-Puffer.[5] Die Wanderungsgeschwindigkeit ist in TAE-Puffer doppelt so hoch wie bei einem TBE-Puffer.[5]