Sōya (jap. 宗谷総合振興局, Sōya-sōgō-shikō-kyoku) ist eine Unterpräfektur der Präfektur Hokkaidō. Sie hat eine Fläche von 4.050,84 km² und eine Einwohnerzahl von 75.665 (Stand: 2005). Sōya ist die nördlichste Unterpräfektur Japans.
Die Unterpräfektur Sōya (宗谷支庁, Sōya-shichō) wurde 1897 eingerichtet.
Am 20. Oktober 1948 wurde das Dorf Toyotomi im Landkreis Teshio aus der Unterpräfektur Rumoi der Unterpräfektur Sōya zugeschlagen.
Bei der Neugliederung von Hokkaidō zum 1. April 2010 erfolgte die Umbenennung in Sōya-sōgō-shikō-kyoku. Dabei wurde ihr die Gemeinde Horonobe aus der Unterpräfektur Rumoi zugeschlagen.
Liste der Landkreise der Unterpräfektur Sōya, sowie deren Städte (町, chō) und Dörfer (村, mura).
In Wakkanai befindet sich der Flughafen Wakkanai und in Rishirifuji der Flughafen Rishiri.