Estaba muy interesado en los sueños, y en 1909 publicó un documento que detallaba su investigación sobre el estado hipnagógico (el estado mental en el que el individuo se encuentra entre la vigilia y el sueño). La argumentación de Silberer era que el estado hipnagógico es autosimbólico, lo que significa que las imágenes y los símbolos percibidos en el estado hipnagógico son representativos del estado físico o mental del perceptor. Llegó a la conclusión de que dos "elementos antagónicos" eran necesarios para que se manifestara el fenómeno autosimbólico: somnolencia y un esfuerzo por pensar.
En 1914, Silberer escribió un libro sobre la relación entre la psicología moderna, el misticismo y las tradiciones esotéricas (sobre todo occidentales, cristianas como el hermetismo, la alquimia, la rosacruz y la francmasonería): Probleme der Mystik und ihrer Symbolik (Problemas de la mística y su simbolismo). Muchas de las ideas que Silberer expone, especialmente respecto de la relación existente entre las imágenes alquímicas y la psicología moderna, eran similares a aquellas desarrolladas más ampliamente por Carl Gustav Jung, un hecho reconocido por este en su trabajo seminal sobre el tema, Psicología y alquimia. El libro de Silberer fue fríamente rechazado por Freud. Silberer llegaría a desanimarse, ahorcándose posteriormente tras ser excomulgado del círculo de asociados de Freud.
1914 d) Das Zerstückelungsmotiv im Mythos. Imago 3, p. 502–523
1915 a) Durch Tod zum Leben. Eine kurze Untersuchung über die entwicklungsgeschichtliche Bedeutung des Symbols der Wiedergeburt in seinen Urformen, mit bes. Berücksichtigung der modernen Theosophie. Heims, Leipzig. (Neuauflage: AAGW, Sinzheim 1997, ISBN 3-937592-07-5)
1919 Der Traum. Einführung in die Traumpsychologie. Stuttgart (Enke)
1919 Zur Entstehung der Symbole. Vortrag, 20. Nov. 1919 in der Großloge Wien
1920 a) The origin and the meaning of the symbols of freemansonry. Psyche & Eros, p. 17–24, p. 84-97
1920 b) The Steinach in mythologie. Psyche & Eros, p. 137-139
1921 a) Der Seelenspiegel. Das enoptrische Moment im Okkultismus. Pfullingen (Baum). (Neuauflage: AAGW, Sinzheim 1997, ISBN 3-937592-07-5)
1921 b) Der Zufall und die Koboldstreiche des Unbewußten. Bern, Leipz. (Bircher)
1921 d) Beyond psychoanalysis. (Reflection on Sigmund Freud's Jenseits des Lustprinzips. 1920.) Psyche & Eros, p. 142–151
1923 a) Der Aberglaube. Bern (Bircher).[1][2][3]
↑Jb. =Jahrbuch für psychoanalytische und psychopathologische Forschungen (ab 1914: Jahrbuch der Psychoanalyse)
↑ZS = Internationale Zeitschrift für ärztliche Psychoanalyse (1913-1919; ab 1920-1937: Internationale Zeitschrift für Psychoanalyse; ab 1939-1941: Internationale Zeitschrift für Psychoanalyse und Imago).
↑(Die Auswahl basiert auf: Bernd Nitzschke: Vorwort. [Zur Neuausgabe von „Probleme der Mystik und ihrer Symbolik…] p. 20f.
Silberer, Herbert (2009). Hidden Symbolism Of Alchemy And The Occult Arts: Understanding Mysticism And Its Symbolism. En inglés. CreateSpace. ISBN 978-1-4414-9726-0.