Open Babel

Open Babel
Información general
Tipo de programa	Científico, análisis de estructuras moleculares; banco de datos.
Desarrollador	Matt Stahl, Pat Walters y Daniel P. Dolata
Modelo de desarrollo	Software Libre
Licencia	GNU
Información técnica
Programado en	C++
Versiones
Última versión estable	3.1.18 de mayo de 2020
Lanzamientos
OELib Open Babel
Archivos legibles
varios Chemical Markup Language International Chemical Identifier MDL Molfile Protein Data Bank Formato FASTA Alchemy Format Gaussian Cube File CDX Format Crystallographic Information File XYZ file format Free Form Fractional format MCDL format
Archivos editables
varios SMILES Chemical Markup Language International Chemical Identifier InChIKey MDL Molfile Multilevel Neighborhoods of Atoms format Free Form Fractional format MCDL format CAChe MolStruct
Enlaces
[1] Repositorio de código
[editar datos en Wikidata]

Open Babel es una aplicación basada en software de código abierto, con funciones de caja de herramientas y diseño, utilizada para almacenar y analizar estructuras químicas moleculares. Se trata de un proyecto abierto, donde los usuarios pueden trabajar en forma colaborativa, con la ventaja de obtener el modelizado y visualización de estructuras complejas, y poder emplear los datos en varios lenguajes y formatos para su reutilización.^[1]​^[2]​

Características

El proyecto de software fue iniciado por Matt Stahl, Pat Walters y Daniel P. Dolata en la Universidad de Arizona.^[3]​ El programa funciona en diferentes sistemas operativos como son Windows, Linux y MacOSX.^[4]​

La idea central del programa, consiste en brindar soluciones para los diversos formatos en que se almacenan los datos moleculares en archivos que pueden ser interconvertidos con esta aplicación. Open Babel facilita el realizar conversiones de 113 formatos diferentes.^[5]​ Mediante la utilización de un sencillo código, se puede efectuar la conversión de archivos de diverso formato, en otros susceptibles de ser leídos.^[6]​

Aplicaciones

Si bien el software ofrece múltiples utilidades en lo relativo a la visualización y reutilización de archivos que pueden ser recuperados en varios formatos, puede además emplearse como una base de datos disponible para disciplinas como química computacional, química orgánica, y farmacología (síntesis de fármacos).^[7]​

Algunos programas que utilizan Open Babel

• Cheméo
• Chemical Structure Project
• GChemPaint
• Kalzium
• Molekel
• OpenMD
• Semantic Web Open Label

Véase también

• Modelado molecular
• Chemsketch
• Ghemical
• WebBabel

Referencias

1. Geoffrey R Hutchison; Chris Morley; Craig James; Chris Swain; Hans De Winter; Tim Vandermeersch; Noel M O’Boyle (Ed.). «Open Babel Documentation» (en inglés). Consultado el 22 de abril de 2015. 
2. Universidad de La Laguna. «Catálogo de Software libre». Archivado desde el original el 10 de marzo de 2016. Consultado el 22 de abril de 2015. 
3. «E-BABEL Interactive Molecular Structure Formats Interconversion Program» (en inglés). Consultado el 22 de abril de 2015. 
4. «Install Open Babel» (en inglés). Consultado el 22 de abril de 2015. 
5. «Open Babel: The Open Source Chemistry Toolbox» (en inglés). Archivado desde el original el 19 de enero de 2022. Consultado el 22 de abril de 2015. 
6. «Supported File Formats and Options» (en inglés). Consultado el 22 de abril de 2015. 
7. Noel M O'Boyle; Michael Banck; Craig A James; Chris Morley; Tim Vandermeersch; Geoffrey R Hutchison. Open Babel: An open chemical toolbox. Consultado el 22 de abril de 2015. 

Enlaces externos

• The Open Bable GUI

• Obabel and babel - Convert, Filter and Manipulate Chemical Data