YTHDF2

YTHDF2
ساختارهای موجود PDB جستجوی هم‌ساخت‌شناسی: PDBe RCSB فهرست شناسه‌های PDB 4RDN, 4RDO, 4WQN
معین‌کننده‌ها
نام‌های دیگر	YTHDF2, HGRG8, NY-REN-2, CAHL, YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 2, DF2
شناسه‌های بیرونی	OMIM: 610640 MGI: 2444233 HomoloGene: 32302 GeneCards: YTHDF2
موقعیت ژن (موش) کروموزوم کروموزوم ۴ (موش)[۱] نوار 4|4 D2.3 شروع 131,912,223 bp[۱] پایان 131,939,614 bp[۱]
هستی‌شناسی ژن عملکرد ملکولی • N6-methyladenosine-containing RNA binding • GO:0001948، GO:0016582 پیوند پروتئینی • RNA binding ترکیبات سلولی • سیتوزول • P-body • هسته یاخته • سیتوپلاسم • microtubule organizing center • cytoplasmic ribonucleoprotein granule فرایند زیستی • humoral immune response • positive regulation of cap-independent translational initiation • regulation of mRNA stability • embryonic morphogenesis • mRNA destabilization • oocyte maturation • negative regulation of Notch signaling pathway • endothelial to hematopoietic transition • regulation of hematopoietic stem cell differentiation • regulation of meiotic cell cycle process involved in oocyte maturation • دگرگونی یاخته‌ • تخمک‌زایی منابع: آمیگو / کوئیک‌گو
هم‌ساخت‌شناسی
گونه‌ها	انسان	موش
Entrez	51441	213541
آنسامبل	ENSG00000198492	ENSMUSG00000040025
یونی‌پروت	Q9Y5A9	Q91YT7
RefSeq (mRNA)	NM_001172828، NM_001173128 NM_016258، NM_001172828، NM_001173128	NM_145393
RefSeq (پروتئین)	NP_001166599، NP_057342 NP_001166299، NP_001166599، NP_057342	NP_663368
موقعیت (UCSC)	ن/م	Chr : 131.91 – 131.94 Mb
جستجوی PubMed	[۲]	[۳]
ویکی‌داده
مشاهده/ویرایش انسان مشاهده/ویرایش موش

پروتئین شمارهٔ ۲ متصل‌شونده به YTH ان۶-متیل‌آدنوزیل آران‌ای (انگلیسی: YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 2) یک پروتئین است که در انسان توسط ژن «YTHDF2» کُدگذاری می‌شود.^[۴]

این ژن یکی از اعضای خانوادهٔ بزرگ YTH و حاوی دومین YTH پروتئین است.

اهمیت بالینی

در یکی از اینترون‌های این ژن یک دومین غنی از Alu شناسایی شده‌است که احتمالاً با طول عمر انسان مرتبط است. همچنین جابه‌جایی کروموزومی#جابه‌جایی‌های متقابل میان این ژن به RUNX1 در کروموزوم ۲۱ در بیماران مبتلا به لوسمی حاد مغز استخوان (AML) مشاهده شده‌است.

منابع

1. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000040025 - Ensembl, May 2017
2. "Human PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
3. "Mouse PubMed Reference:". National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
4. "Entrez Gene: YTH N6-methyladenosine RNA binding protein 2". Retrieved 2017-12-24.

• مشارکت‌کنندگان ویکی‌پدیا. «YTHDF2». در دانشنامهٔ ویکی‌پدیای انگلیسی، بازبینی‌شده در ۲۵ آوریل ۲۰۱۹.

برای مطالعهٔ بیشتر

• Scanlan MJ, Gordan JD, Williamson B, Stockert E, Bander NH, Jongeneel V, Gure AO, Jäger D, Jäger E, Knuth A, Chen YT, Old LJ (1999). "Antigens recognized by autologous antibody in patients with renal-cell carcinoma". Int. J. Cancer. 83 (4): 456–64. PMID 10508479.
• Cardelli M, Marchegiani F, Cavallone L, Olivieri F, Giovagnetti S, Mugianesi E, Moresi R, Lisa R, Franceschi C (2006). "A polymorphism of the YTHDF2 gene (1p35) located in an Alu-rich genomic domain is associated with human longevity". J. Gerontol. A Biol. Sci. Med. Sci. 61 (6): 547–56. PMID 16799135.
• Cardelli M, Marchegiani F, Cavallone L, Olivieri F, Giovagnetti S, Mugianesi E, Moresi R, Lisa R, Franceschi C (2006). "A polymorphism of the YTHDF2 gene (1p35) located in an Alu-rich genomic domain is associated with human longevity". J. Gerontol. A Biol. Sci. Med. Sci. 61 (6): 547–56. PMID 16799135.
• Wang X, Lu Z, Gomez A, Hon GC, Yue Y, Han D, Fu Y, Parisien M, Dai Q, Jia G, Ren B, Pan T, He C (2014). "N6-methyladenosine-dependent regulation of messenger RNA stability". Nature. 505 (7481): 117–20. doi:10.1038/nature12730. PMC 3877715. PMID 24284625.
• Li F, Zhao D, Wu J, Shi Y (2014). "Structure of the YTH domain of human YTHDF2 in complex with an m(6)A mononucleotide reveals an aromatic cage for m(6)A recognition". Cell Res. 24 (12): 1490–2. doi:10.1038/cr.2014.153. PMC 4260351. PMID 25412658.
• Zhu T, Roundtree IA, Wang P, Wang X, Wang L, Sun C, Tian Y, Li J, He C, Xu Y (2014). "Crystal structure of the YTH domain of YTHDF2 reveals mechanism for recognition of N6-methyladenosine". Cell Res. 24 (12): 1493–6. doi:10.1038/cr.2014.152. PMC 4260350. PMID 25412661.
• Xu C, Liu K, Ahmed H, Loppnau P, Schapira M, Min J (2015). "Structural Basis for the Discriminative Recognition of N6-Methyladenosine RNA by the Human YT521-B Homology Domain Family of Proteins". J. Biol. Chem. 290 (41): 24902–13. doi:10.1074/jbc.M115.680389. PMC 4598999. PMID 26318451.
• Tirumuru N, Zhao BS, Lu W, Lu Z, He C, Wu L (2016). "N(6)-methyladenosine of HIV-1 RNA regulates viral infection and HIV-1 Gag protein expression". eLife. 5. doi:10.7554/eLife.15528. PMC 4961459. PMID 27371828.