ترموس

ترموس
ترموس آکواتیکوس
رده‌بندی علمی
حوزه:
باکتری‌ها
شاخه:
Deinococcota
رده:
Deinococci
راسته:
ترمال‌ها
تیره:
ترمال‌ها
سرده:
ترموس

براک و فریز ۱۹۶۹

ترموس سرده‌ای از باکتری‌های گرمادوست و یکی از چندین سردهٔ باکتریایی متعلق به شاخهٔ داینوکوکوتا است. گونه‌های ترموس را می‌توان از سایر سرده‌های خانوادهٔ ترمال‌ها و همچنین تمام باکتری‌های دیگر با حضور هشت ایندل حفاظت‌شده (CSIs)، موجود در پروتئین‌هایی مانند آدنیلات کیناز و دی‌ان‌ای هلیکاز همانندسازی‌کننده و همچنین ۱۴ پروتئین حفاظت‌شده (CSPs)، متمایز کرد که به‌طور انحصاری، در اعضای این سرده مشترک هستند.[۱]

گونه‌ها

[ویرایش]

سردهٔ ترموس، شامل گونه‌های زیر است:[۲][۳][۴]

  • " T. Caldophilus " * تاگوچی و همکاران. ۱۹۸۳
  • " T. eggertssonii " * پیترز ۲۰۰۸
  • " T. kawarayensis " * کوروساوا و همکاران. ۲۰۰۵
  • " T. murrieta " * بنر و همکاران. ۲۰۰۶
  • " T. nonproteolyticus " * ۱۹۹۲
  • " T. parvatiensis " * دویدی و همکاران. ۲۰۱۵
  • " T. rehai " * لین و همکاران. ۲۰۰۲
  • " T. yunnanensis " * گونگ و همکاران. ۲۰۰۵
  • Thermus amyloliquefaciens یو و همکاران. ۲۰۱۵[۵]
  • Thermus antranikianii ۲۰۰۰[۶]
  • ترموس آکواتیکوس براک و فریز، ۱۹۶۹[۷]
  • Thermus arciformis ژانگ و همکاران. ۲۰۱۰[۸]
  • Thermus brockianus ویلیامز ۱۹۹۹[۹]
  • Thermus caldifontis خان و همکاران. ۲۰۱۷
  • Thermus caliditerrae مینگ و همکاران. ۲۰۱۴[۱۰]
  • Thermus chliarophilus تنریو و همکاران. ۱۹۹۵[۱۱]
  • Thermus composti واینا و همکاران. ۲۰۱۲[۱۲]
  • Thermus filiformis هادسون ۱۹۸۷[۱۳]
  • Thermus igniterrae ۲۰۰۰[۶]
  • Thermus islandicus ۲۰۰۹[۱۴]
  • Thermus oshimai ویلیامز و همکاران. ۱۹۹۶[۱۵]
  • Thermus scotoductus ۱۹۹۴[۱۶]
  • Thermus tengchongensis یو، یائو، مینگ، یین، ژو، لیو، تانگ و لی، ۲۰۱۳[۱۷]
  • ترموس ترموفیلوس ۱۹۷۴، سپس ۱۹۹۵[۱۸]

فیلوژنی

[ویرایش]

طبقه‌بندی پذیرفته شده در حال حاضر بر اساس فهرست نام‌های پروکاریوتی (LPSN) و بررسی آران‌ای ریبوزومی ۱۶اِس[۱۹] و مرکز ملی اطلاعات بیوتکنولوژی (NCBI)[۲۰] به‌صورت زیر است.[۲۱]

 
 

T. oshimai Williams et al. 1996

 
 
 

T. filiformis Hudson et al. 1987

 
 
 

T. thermophilus (ex Oshima and Imahori 1974) Manaia et al. 1995

 
 
 

T. composti Vajna et al. 2012

 
 
 
 

T. antranikianii Chung et al. 2000

 
 
 

T. scotoductus Kristjansson et al. 1994

 
 
 

T. caliditerrae Ming et al. 2014

 
 

T. tengchongensis Yu et al. 2013

 
 
 
 
 
 
 

T. brockianus Williams et al. 1995

 
 

T. igniterrae Chung et al. 2000

 
 
 
 

T. aquaticus Brock and Freeze 1969

 
 
 

T. arciformis Zhang et al. 2010

 
 

T. islandicus Bjornsdottir et al. 2009

 
 
 
 
 
 
 
 
 

نکته: سویه‌هایی که در مرکز ملی اطلاعات زیست‌فناوری (NCBI) یافت شده‌اند، اما در فهرست نام‌های پروکاریوتی با نام‌گذاری (LPSN) فهرست نشده‌اند با علامت * مشخص شده‌اند.

جستارهای وابسته

[ویرایش]

منابع

[ویرایش]
  1. ↑ Ho, Jonathan; Adeolu, Mobolaji; Khadka, Bijendra; Gupta, Radhey S. (October 2016). "Identification of distinctive molecular traits that are characteristic of the phylum "Deinococcus–Thermus" and distinguish its main constituent groups". Systematic and Applied Microbiology. 39 (7): 453–463. doi:10.1016/j.syapm.2016.07.003. ISSN 0723-2020.
  2. ↑ Brock TD; Freeze H (1969). "Thermus aquaticus, a Nonsporulating Extreme Thermophile". J. Bacteriol. 98 (1): 289–97. doi:10.1128/jb.98.1.289-297.1969. PMC 249935. PMID 5781580.
  3. ↑ Chung, A. P.; Rainey, F. A.; Valente, M.; Nobre, M. F.; da Costa, M. S. (2000). "Thermus igniterrae sp. nov. and Thermus antranikianii sp. nov. , two new species from Iceland". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50 (1): 209–217. doi:10.1099/00207713-50-1-209. ISSN 1466-5026. PMID 10826806.
  4. ↑ LSPN. "Thermus". LPSN. Retrieved 2016-03-10.
  5. ↑ Yu, Tian-Tian; Park, Dong-Jin; Hozzein, Wael N.; Kim, Chang-Jin; Wadaan, Mohammed A. M.; Ming, Hong; Li, Wen-Jun; Yao, Ji-Cheng; Zhou, En-Min (2015-08-01). "Thermus amyloliquefaciens sp. nov. , isolated from a hot spring sediment sample". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 65 (8): 2491–2495. doi:10.1099/ijs.0.000289. PMID 25920724.
  6. ↑ ۶٫۰ ۶٫۱ Chung, A. P.; Rainey, F. A.; Valente, M.; Nobre, M. F.; Costa, M. S. da (2000-01-01). "Thermus igniterrae sp. nov. and Thermus antranikianii sp. nov. , two new species from Iceland". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 50 (1): 209–217. doi:10.1099/00207713-50-1-209. PMID 10826806.
  7. ↑ Brock, Thomas D.; Freeze, Hudson (1969-04-01). "Thermus aquaticus gen. n. and sp. n. , a Nonsporulating Extreme Thermophile". Journal of Bacteriology (به انگلیسی). 98 (1): 289–297. doi:10.1128/jb.98.1.289-297.1969. ISSN 0021-9193. PMC 249935. PMID 5781580.
  8. ↑ Zhang, X. Q.; Ying, Y.; Ye, Y.; Xu, X. W.; Zhu, X. F.; Wu, M. (2010-04-01). "Thermus arciformis sp. nov. , a thermophilic species from a geothermal area". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 60 (4): 834–839. doi:10.1099/ijs.0.007690-0. PMID 19661520.
  9. ↑ WILLIAMS, R. A. D.; SMITH, K. E.; WELCH, S. G.; MICALLEF, J.; SHARP, R. J. (1995-07-01). "DNA Relatedness of Thermus Strains, Description of Thermus brockianus sp. nov. , and Proposal To Reestablish Thermus thermophilus (Oshima and Imahori)". International Journal of Systematic Bacteriology. 45 (3): 495–499. doi:10.1099/00207713-45-3-495. PMID 8590676.
  10. ↑ Ming, H.; Yin, Y. -R.; Li, S.; Nie, G. -X.; Yu, T. -T.; Zhou, E. -M.; Liu, L.; Dong, L.; Li, W. -J. (2014-02-01). "Thermus caliditerrae sp. nov. , a novel thermophilic species isolated from a geothermal area". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 64 (Pt 2): 650–656. doi:10.1099/ijs.0.056838-0. PMID 24158953.
  11. ↑ TENREIRO, S.; NOBRE, M. F.; COSTA, M. S. DA (1995-10-01). "Thermus silvanus sp. nov. and Thermus chliarophilus sp. nov. , Two New Species Related to Thermus ruber but with Lower Growth Temperatures". International Journal of Systematic Bacteriology. 45 (4): 633–639. doi:10.1099/00207713-45-4-633. PMID 7547281.
  12. ↑ Vajna, B.; Kanizsai, S.; Keki, Z.; Marialigeti, K.; Schumann, P.; Toth, E. M. (2012-07-01). "Thermus composti sp. nov. , isolated from oyster mushroom compost". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 62 (Pt 7): 1486–1490. doi:10.1099/ijs.0.030866-0. PMID 21856987.
  13. ↑ Hudson, J. A.; Morgan, H. W.; Daniel, R. M. (1987-01-01). "Thermus filiformis sp. nov. , a Filamentous Caldoactive Bacterium". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 37 (4): 431–436. doi:10.1099/00207713-37-4-431.
  14. ↑ Bjornsdottir, Snaedis H.; Petursdottir, Solveig K.; Hreggvidsson, Gudmundur O.; Skirnisdottir, Sigurlaug; Hjorleifsdottir, Sigridur; Arnfinnsson, Johann; Kristjansson, Jakob K. (2009-01-01). "Thermus islandicus sp. nov. , a mixotrophic sulfur-oxidizing bacterium isolated from the Torfajokull geothermal area". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 59 (12): 2962–2966. doi:10.1099/ijs.0.007013-0. PMID 19628590.
  15. ↑ WILLIAMS, RALPH A. D.; SMITH, KELVIN E.; WELCH, SIMON G.; MICALLEF, JANICE (1996-01-01). "Thermus oshimai sp. nov. , Isolated from Hot Springs in Portugal, Iceland, and the Azores, and Comment on the Concept of a Limited Geographical Distribution of Thermus Species". International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. 46 (2): 403–408. doi:10.1099/00207713-46-2-403. PMID 8934898.
  16. ↑ Kristjánsson, Jakob; Hjörleifsdóttir, Sigrídur; Marteinsson, Viggó; Alfredsson, Gudni (1994). "Thermus scotoductus, sp. nov. , a Pigment-Producing Thermophilic Bacterium from Hot Tap Water in Iceland and Including Thermus sp. X-1". Systematic and Applied Microbiology. 17 (1): 44–50. doi:10.1016/S0723-2020(11)80030-5.
  17. ↑ Yu, Tian-Tian; Yao, Ji-Cheng; Ming, Hong; Yin, Yi-Rui; Zhou, En-Min; Liu, Min-Jiao; Tang, Shu-Kun; Li, Wen-Jun (2013). "Thermus tengchongensis sp. nov. , isolated from a geothermally heated soil sample in Tengchong, Yunnan, south-west China". Antonie van Leeuwenhoek. 103 (3): 513–518. doi:10.1007/s10482-012-9833-9. PMID 23104072.
  18. ↑ Manaia, Célia M.; Hoste, Bart; Carmen Gutierrez, M.; Gillis, Monique; Ventosa, Antonio; Kersters, Karel; Da Costa, Milton S. (1995-02-01). "Halotolerant Thermus Strains from Marine and Terrestrial Hot Springs Belong to Thermus thermophilus (ex Oshima and Imahori, 1974) nom. rev. emend". Systematic and Applied Microbiology. 17 (4): 526–532. doi:10.1016/S0723-2020(11)80072-X.
  19. ↑ J.P. Euzéby. "Deinococcus–Thermus". List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN). Retrieved 2018-07-20.
  20. ↑ Sayers; et al. "Deinococcus–Thermus". National Center for Biotechnology Information (NCBI) taxonomy database. Retrieved 2018-07-20.
  21. ↑ "16S rRNA-based LTP release 132 (full tree)". All-Species Living Tree Project. Silva Comprehensive Ribosomal RNA Database. Retrieved 2018-07-20.