درمان جایگزینی با آنزیم (انگلیسی: Enzyme replacement therapy، به اختصار ERT) یا آنزیم‌درمانی نوعی روش درمانی در پزشکی است که در آن، آنزیمی را که دچار کمبود یا فقدان است، جایگزین می‌کنند.[۱] عموماً این کار از طریق تزریق داخل وریدی محلولی که حاوی آنزیمِ موردِ نظر باشد، انجام می‌شود.[۱]
این روش درمانی، هم‌اکنون برای تعدادی از بیماری‌های ذخیرهٔ لیزوزوم در دسترس است: بیماری گوشه، بیماری فابری، موکوپلی‌ساکاریدوز، بیماری هانتر، بیماری ماروتو-لامی و بیماری پومپه[۱]
آنزیم‌درمانی علتِ زمینه‌ای و اصلیِ بیماری را برطرف نمی‌کند، بلکه تنها غلظت آنزیمی را که دچار کمبود است، افزایش می‌دهد. این روش در درمان «نقش ایمی مرکب شدید» و «نقص ایمنی ناشی از کمبود آدنوزین دآمیناز» بکار رفته‌است.[۲]
برای اینگونه بیماری‌ها، از روش‌های جدید دیگری همچون پیوند مغز استخوان و ژن‌درمانی هم می‌توان استفاده کرد.[۱]