مؤسسۀ پژوهشی اسکریپس (به انگلیسی: Scripps Research Institute) یک مؤسسه تحقیقاتی خصوصی و بسیار معتبر آمریکایی در زمینه زیستپزشکی است. این مؤسسه در سال ۱۹۲۴ در شهر لا هویا ایالت کالیفرنیا تأسیس گردید و در فلوریدا نیز یک شعبه دارد.[۱] مؤسسه تحقیقات اسکریپس نزدیک به ۱۰۰۰ ثبت اختراع، ۹ داروی درمانی تأییدشده توسط FDA، و بیش از ۵۰ شرکت اسپین-آف تولید کرده است.[۲] براساس شاخص نشریه نیچر در سال ۲۰۱۷، موسسه تحقیقات اسکریپس مؤثرترین مؤسسه تحقیقاتی جهان بالاتر از دانشگاه راکفلر و مؤسسه فناوری ماساچوست بودهاست.[۳] برنامههای تحصیلات عالی مؤسسه پژوهشی اسکریپس در علوم زیستی در رتبه ۱۰ کشور، رتبه ۵ برای شیمی ارگانیک، و ۲ برای بیوشیمی قرار دارند.[۴]
کورت ووتریش و کارل شارپلس دو برنده جایزه نوبل از استادان موسسه تحقیقاتی اسکریپس هستند.
داروهای درمانی تأییدشده توسط FDA که در مؤسسه پژوهشی اسکریپس ساخته شدهاند:[۵]