پایگاه فراداده تنوع باکتریایی

پایگاه فراداده تنوع باکتریایی
محتوا
توضیحاطلاعات مرتبط با خصوصیات تنوع زیستی باکتری‌ها و باستانیان
گونه‌های داده‌های
گرفته‌شده
فراداده
تماس
مرکز پژوهشمجموعه میکروارگانیسم‌ها و کشت سلولی آلمان(GmbH)
استناد ابتداییPMID 26424852
تاریخ انتشار۲۰۱۲
دسترسی
وب‌گاهhttp://bacdive.dsmz.de/
نشانی اینترنتی خدمات وبhttp://bacdive.dsmz.de/api/

پایگاه فراداده تنوع باکتریایی (به انگلیسی: the Bacterial Diversity Metadatabase، یا BacDive)، یک پایگاه فراداده است که اطلاعات مرتبط با خصوصیات تنوع زیستی باکتری‌ها و باستانیان را تهیه می‌کند.

مقدمه

[ویرایش]

این پایگاه منبعی برای انواع مختلف فراداده مثل طبقه‌بندی، مرفولوژی، فیزیولوژی، محیط زیست و زیست‌شناسی مولکولی است.[۱][۲][۳][۴][۵] اکثریت داده‌ها به صورت دستی حاشیه‌نویسی شده و سرپرستی می‌شوند. این پایگاه با انتشار در سپتامبر ۲۰۱۵ اطلاعاتی در مورد ۵۳٬۹۷۸ نژاد ارائه می‌دهد.[۶] این پایگاه داده که بخشی از de.NBI شبکه آلمانی برای زیرساخت بیوانفورماتیک است توسط مجموعه میکروارگانیسم‌ها و کشت سلولی آلمان(GmbH) میزبانی می‌شود.

منابع

[ویرایش]
  1. Söhngen, C; Boyke, B; Podstawka, A; Gleim, D; Overmann, J (October 13, 2013). "BacDive - The Bacterial Diversity Metadatabase". Nucleic Acids Research. 42 (Database issue): D592–D599. doi:10.1093/nar/gkt1058.
  2. Fernández-Suárez, X. M.; Rigden, D. J.; Galperin, M. Y. (December 5, 2013). "The 2014 Nucleic Acids Research Database Issue and an updated NAR online Molecular Biology Database Collection". Nucleic Acids Research. 42: D1–D6. doi:10.1093/nar/gkt1282. PMC 3965027. PMID 24316579.
  3. Cohan lab (October 23, 2015). "DSMZ's BacDive Bacterial Diversity Database".
  4. Abu-Jamous, Basel; Fa, Rui; Nandi, Asoke K. (2015). Integrative Cluster Analysis in Bioinformatics. John Wiley & Sons. p. 448.
  5. Zhulin, I. B. (August 1, 2015). "Databases for Microbiologists". Journal of Bacteriology. 197 (15): 2458–2467. doi:10.1128/JB.00330-15.
  6. Söhngen, C; Podstawka, A; Boyke, B; Gleim, D; Vetcininova, A; Reimer, LC; Ebeling, C; Pendarovski, C; Overmann, J (September 30, 2015). "BacDive - The Bacterial Diversity Metadatabase in 2016". Nucleic Acids Research. 44 (Database issue): D581–D585. doi:10.1093/nar/gkv983. PMC 4702946. PMID 26424852.

پیوند به بیرون

[ویرایش]