کاتپسین (انگلیسی: Cathepsin) گروهی از آنزیمهای پروتئاز هستند که پروتئینها را تجزیه میکنند و در بسیاری از جانداران دیده میشوند. در زبان یونانی باستان kata به معنای نزول یا پائین و hepsein به معنای جوشاندن یا آبپز کردن است. این خانوادهٔ آنزیمی چندین عضو دارد که بهواسطهٔ ساختار، نحوهٔ عملکرد و مادهٔ هدف، از هم تمیز داده میشوند. بیشتر اعضای این خانواده در شرایط اسیدی (پیاچ پائین) که در لیزوزومها مهیاست، فعال میشوند و در نتیجه، فقط داخل این اندامکها (که چنینی شرایط اسیدی دارند) فعالیت دارند. تنها استثنای این قاعده، کاتپسین K است که در فضای خارجسلولی بدنبال ترشح از استئوکلاستها فعالیت میکند. این خانوادهٔ آنزیمی نقش مهمی در عملکرد و تغییروتحولِ سلولی ایفا میکنند.