در سال ۱۸۶۸ میلادیامپراتور میجی در اولین سال امپراتوری خود نام قلعه ادو را به قلعه توکیو تغییر داد و این مکان به عنوان محل اقامت امپراتوران ژاپن انتخاب شد.
در سال ۱۸۷۳ میلادی به علت آتش سوزیای که در قصر رخ داد. محل اقامت امپراتور به طور موقت به گئی رینکان (به ژاپنی: 迎賓館 Geihinkan) منتقل شد.
در سال ۱۸۸۸ میلادی قصر جدید در این مکان افتتاح شد و بنام جدید کیوجو (به ژاپنی: 宮城) خوانده شد.
در سال ۱۹۴۵ میلادی در اثر بمباران هوایی قصر اصلی دچار آتش سوزی شده و امپراتور شووا به طور موقت در قصر دیگری اقامت گزید. امپراتور بعد از جنگ ساخت خانههای مردم را که طی جنگ و بمبارانهای مهیب از بین رفته بود به ترمیم قصر مقدم دانسته و ساخت قصر را به سالهای بعد موکول کرد.
در سال ۱۹۴۸ میلادی نام قصر به کُوکیو (به ژاپنی: 皇居 kōkyo) تغییر پیدا کرد.
در سال ۱۹۶۸ میلادی بعد از چهار سال کار ساخت قصر جدید امپراتور به پایان رسید اما قصر جدید به طور رسمی از سال بعد مورد استفادهٔ امپراتور شووا قرار گرفت.
از سال ۱۹۶۸ میلادی قسمت شرقی قصر در معرض بازدید عموم قرار گرفتهاست و بازدید از آن برای همگان آزاد است. در داخل این محوطه موزهٔ سلطنتی ساننومارو (به ژاپنی: 三の丸尚蔵館) یا (به انگلیسی: Museum of the Imperial Collections) قرار دارد. از سال ۱۹۹۳ میلادی ورود و بازدید از این موزه رایگان شدهاست.