Herbert Boyer (s. 10. heinäkuuta 1936) on yhdysvaltalainen biokemisti, joka ensimmäisenä vuonna 1973 onnistui muuttamaan eliön perimää ujuttamalla erään bakteerin perimään toisen lajin DNA:ta.[1] Näin hän loi yhdistelmä-DNA-tekniikan.
Boyer valmistui tohtoriksi Pittsburghin yliopistosta 1963. Työskenneltyään eri laboratorioissa hän päätyi Kalifornian yliopiston Berkeleyn kampukselle biokemian professoriksi. Tähän aikaan tutkijoille oli selvinnyt, että DNA:n emäsjärjestys määrää, millaisia proteiineja solu tuottaa. Boyer onnistui vuonna 1973 muuttamaan Escherichia coli -bakteerin emäsjärjestystä siirtämällä sen DNA:han vieraasta lajista otettua DNA:ta.[1] Vuonna 1976 Boyer perusti yhdessä pääomasijoittaja Robert A. Swansonin kanssa Genentech-yrityksen erityisesti synteettisen insuliinin tuottamiseen. Yritys on laajentunut monille lääketeollisuuden aloille. Boyer sai The Economist -talousaikakauslehden innovatiivisuuspalkinnon yhdessä Stanley Cohenin kanssa 2005.