Markus Kilsgaard (s. 23. helmikuuta 1992 Herning) on tanskalainen alppihiihtäjä. Hän edustaa seuratasolla Skiklubben Hareskovia.[1]
Kilsgaard osallistui olympialaisiin ensimmäistä kertaa vuonna 2010.[1] Tuolloin hän kilpaili suurpujottelussa, jossa hänet hylättiin ensimmäisellä kierroksella.[1] Kilsgaard oli seuraavana vuonna mukana juniorien MM-kisoissa, joissa hän keskeytti sekä pujottelussa että suurpujottelussa.[2]