Sanger-instituutti (engl. Wellcome Trust Sanger Institute, ent. Sanger Centre) on genomiikan tutkimuslaitos[1], joka sijaitsee Wellcome Trust Genome -kampuksella Cambridgeshiren Hinxtonin kylässä. Laitos on nimetty kaksinkertaisen Nobelin kemianpalkinnon voittajan Frederick Sangerin mukaan. Instituuttia rahoittava The Wellcome Trust on suurin tutkimusta rahoittava säätiö Englannissa ja Bill ja Melinda Gatesin säätiön jälkeen suurin lääketieteen tutkimusta rahoittava säätiö maailmassa[1].
Sanger-instituutin perustivat Wellcome Trust ja Britannian Medical Research Council vuonna 1993[2]. Tehtäväksi instituutille annettiin genomitiedon kasvattaminen, keskittyen erityisesti ihmisgenomin sekvensointiin ja tulkintaan. Tästä informaatiosta tulisi pohja tulevaisuuden ihmisbiologian ja -sairausten tutkimukselle[3].
Sanger-instituutissa toimivat tohtorikoulutettavat kuuluvat Cambridgen yliopistoon.
Leena Palotie johti syyskuusta 2007 Sanger-instituutin ihmisgenetiikan tutkimusohjelmaa[1].