Alberto Fernandez Sainz est le fils d'Alberto Fernández Blanco, cycliste professionnel de 1978 à 1984, et d'Inmaculada Sainz, morts dans un accident de la circulation le , laissant leur fils Alberto orphelin à trois ans[1]. Celui-ci est élevé par ses grands parents maternels. Il commence le cyclisme durant son enfance et s'inscrit au CC Besaya à 14 ans[2]. À l'âge de 18 ans, il décide de faire des études. Sa carrière cycliste est alors mise en sommeil jusqu'en 2005.[réf. souhaitée] Il passe professionnel en 2008, à l'âge de 26 ans, chez Karpin-Galicia. Il a notamment remporté la Bizkaiko Bira(es) en 2007. Il participe au Tour d'Espagne 2009, qu'il abandonne à la onzième étape à la suite d'une chute. Il participe fin 2009 à la commémoration des 25 ans de la mort de son père dont il dit n'avoir aucun souvenir.