Il devient professeur ordinaire de géologie et de minéralogie de l'université de Gênes en 1866, poste définitif en 1870, jusqu'en 1891. Il est élu directeur du musée géologique de l'université de Gênes en 1891 et démissionne de la chaire de minéralogie pour se dédier entièrement à celle de géologie et à sa charge de directeur du musée, jusqu'en 1917.
Il s'intéresse à la préparation des naturalistes avant leurs voyages et écrit plusieurs manuels à ce sujet, ainsi qu'à l'archéologiepréhistorique. Le professeur Issel devient président de la Société géologique italienne en 1893 et en 1921 et 1922 (année de sa mort) de la Società Ligure di Storia Patria[1].
Son fils, Raffaele Issel, devient professeur de zoologie de l'université de Gênes en 1923.
Liguria geologica e preistorica, con note e disegni originali di N. Morelli; panorami e fotografie di G. Dalle piane, 3 vol. (2 vol. di testo e un atlante), Genova, Antonio Donath Editore, 1882.
Bibliografia scientifica della Liguria, (geologia, paleontologia, mineralogia, geografia, meteorologia, etnografia, paletnologia e scienze affini), Genova, Tip. Marittima, 1887.
Compendio di geologia, col concorso dell'ing. S. Traverso. Parte 1, Torino, Unione-Tipografica-Editrice, 1896.
Compendio di geologia, col concorso dell'ing. S. Traverso. Parte 2, Torino, Unione-Tipografica-Editrice, 1897.
Viaggio nel Mar Rosso e tra i Bogos, E. Treves editore, Milano, 1872.
(a cura di Arturo Issel), Istruzioni Scientifiche pei viaggiatori raccolte da Arturo Issel in collaborazione dei signori Giovanni Celoria, Michele Stefano De Rossi, Raffaello Gestro, Enrico Giglioli, Guido Grassi, Angiolo Manzoni, Antonio Piccone, Gustavo Uzielli e Arturo Zannotti, Ministero di Agricoltura, Industria e Commercio, Roma, ed. eredi Botta, 1881, 556 pp.
Malacologie
A. Issel (1874). Molluschi Borneensi. Genova, Tipografia del R. Instituto Sordo-Muti.
(it) Antonio Cappellini, Dizionario biografico di genovesi illustri e notabili: cronologia dei governi di Genova ed indice alfabetico-analitico, Genova, frat. Pagano, 1936, p. 97.
(it) Michele Castelnovi, La preparazione dei viaggiatori secondo Arturo Issel (con documenti inediti 1889-1891), in «Bollettino della Società Geografica Italiana», serie XII (2006), vol. XI, n.2 (aprile-giugno), pp. 429–460.
(en) Cesare Conci et Roberto Poggi (1996), Iconography of Italian Entomologists, with essential biographical data. Memorie della Società entomologica italiana, 75 : 159-382. (ISSN0037-8747)