Bothrops marajoensis est une espèce de serpents de la famille des Viperidae[1].
Cette espèce est endémique du Brésil. Elle se rencontre dans l’État de Pará[1].
Le statut d'espèce distincte est discuté. Certains pensent qu'elle pourrait être conspécifique de Bothrops atrox car il n'existe pas de différence morphologique avec cette dernière[1].
Son nom d'espèce, composé de marajo et du suffixe latin -ensis, « qui vit dans, qui habite », lui a été donné en référence au lieu de sa découverte, l'île de Marajó.