Chloroflexota

Chloroflexota
Description de l'image Phylum-Chloroflexi-isolate-Anaerolineae-bacterium-HOT-439-is-dependent-on-a-helper-strain.png.
Classification LPSN
Domaine Bacteria

Embranchement

Chloroflexota
Garrity & Holt 2021[1]

Synonymes

  • Chloroflexota Whitman et al. 2018
  • Chloroflexaeota Oren et al. 2015
  • Chlorobacteria Cavalier-Smith 2006
  • Eobacteria Cavalier-Smith 2002
  • Chloroflexi Garrity & Holt 2001
Échantillon de Phylum Chloroflexi

Les Chloroflexota – anciennement Chlorobacteria (en français les Chlorobactéries) – forment un embranchement (ou phylum, ou encore division) du règne des Bacteria. Son nom provient de Chloroflexus qui est le genre type de cet embranchement.

Certains auteurs pensent que ce phylum pourrait être l'un des plus anciens existant encore.

Historique

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Thomas Cavalier-Smith a fait du phylum Chlorobacteria un des phylums de sa classification[2]. Il est possible que ce soit l'embranchement bactérien le plus ancien qui existe encore à l'heure actuelle[3] : la racine de l'arbre du vivant pourrait donc se trouver parmi les chlorobactéries ou bien entre les chlorobactéries et le reste du vivant.

Les chlorobactéries tirent leur nom du genre Chloroflexus, qui a lui-même donné son nom à la classe des Chloroflexi. Les chlorobactéries possèdent des métabolismes variés même si le plus typique est la photohétérotrophie anoxygénique des chloroflèxes. En 2021, Oren et Garrity rectifient la nomenclature des phyla bactérien et parmi ceux-ci celui des chlorobactéries qui deviennent les Chloroflexota[1].

Taxonomie

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Étymologie

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L'étymologie de ce phylum Chloroflexota est la suivante : Chlo.ro.fle.xo’ta N.L. masc. n. Chloroflexus, genre type de ce phylum; N.L. neut. pl. n. suff. -ota, suffixe pour définir un phylum; N.L. neut. pl. n. Chloroflexota, le phylum des Chloroflexus[1],[4].

Liste des classes

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Selon la LPSN (11 novembre 2022)[5] :

Liste des Candidatus

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Selon la LPSN (11 novembre 2022)[5], plusieurs classes n'ont pas été publiées de manière valide et sont en attente de validation:

  • "Candidatus Bathosphaeria" Mehrshad et al. 2018
  • "Candidatus Limnocylindria" Mehrshad et al. 2018
  • "Candidatus Thermofontia" corrig. Ward et al. 2018
  • "Candidatus Umbricyclopia" Mehrshad et al. 2018

Controverse sur leur structure

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Les chlorobactéries sont traditionnellement considérées comme des bactéries Gram négative à structure bimembranée. Il semblerait pourtant que certains membres aient une structure unimembranée[6], ce qui jette le doute sur la monophylie de ce taxon.

Position phylogénétique supposée

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 phyl. Chlorobacteria




 phyl. Hadobacteria




 phyl. Cyanobacteria



 infrareg. Gracilicutes

 phyl. Spirochaetae




 phyl. Sphingobacteria




 phyl. Proteobacteria



 phyl. Planctobacteria







 phyl. Eurybacteria (paraphylétique)


 clade unimembrana

 subphyl. Endobacteria




 subphyl. Actinobacteria


 clade neomura

 phyl. Archaebacteria



 imp. Eukaryota










Article détaillé : Eubacteria (classification phylogénétique).

Classification

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‘Candidatus Chlorothrix’♠

Classe Anaerolineae

Classe Chloroflexi

Classe Dehalococcoidetes

Classe Ktedonobacteria

Classe Thermomicrobia

Note: ♠ Strain found at the National Center for Biotechnology Information (NCBI) but not recognised by List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN) or published by International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology (IJSB/IJSEM).

Notes et références

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  1. ↑ a b et c Oren et Garrity 2021, p. 3.
  2. ↑ Thomas Cavalier-Smith, 1998. A revised six-kingdom system of life. Biol. Rev. 73: 203-266.
  3. ↑ Thomas Cavalier-Smith, 2006. Rooting the tree of life by transition analyses. Biol Direct. ; 1: 19. doi: 10.1186/1745-6150-1-19
  4. ↑ (en) « Phylum Chloroflexota », sur LPSN - List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (consulté le ).
  5. ↑ a et b List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN), consulté le 11 novembre 2022
  6. ↑ (en) Iain C. Sutcliffe, « A phylum level perspective on bacterial cell envelope architecture », Trends in Microbiology, vol. 18, no 10,‎ , p. 464-470 (DOI 10.1016/j.tim.2010.06.005).

Bibliographie

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  • (en) A Oren et GM Garrity, « Valid publication of the names of forty-two phyla of prokaryotes », Int J Syst Evol Microbiol, vol. 71, no 10,‎ , p. 005056 (DOI 10.1099/ijsem.0.005056)

Liens externes

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