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Le Conservatoire botanique national méditerranéen de Porquerolles a été créé le . Il a été agréé « Conservatoire botanique national » en .
Il intervient sur l'ensemble des régions méditerranéennes françaises : Languedoc-Roussillon, Provence-Alpes-Côte d'Azur hors départements des Hautes-Alpes et Alpes de Haute Provence concernés par le conservatoire botanique national alpin.
Le Conservatoire Botanique National méditerranéen (Porquerolles) possède une antenne régionale à Montpellier, logée au 2e étage de l'Institut de Botanique.