EBF1

EBF1
Structure de la protéine EBF1. Basée sur l'identifiant PDB 3LYR.
Structures disponibles PDB Recherche d'orthologue: PDBe RCSB Identifiants PDB 3LYR, 3MQI
Identifiants
Aliases	EBF1, Facteur de transcription COE1
IDs externes	OMIM: 164343 MGI: 95275 HomoloGene: 7297 GeneCards: EBF1
Position du gène (Homme) Chr. Chromosome 5 humain[1] Locus 5q33.3 Début 158,695,916 bp[1] Fin 159,099,916 bp[1]
Position du gène (Souris) Chr. Chromosome 11 (souris)[2] Locus 11 B1.1|11 26.45 cM Début 44,617,317 bp[2] Fin 45,008,091 bp[2]
Expression génétique Bgee Humain Souris (orthologue) Fortement exprimé dans jointure synoviale membrane synoviale tendon calcanéen ovocyte buccal mucosa cell skin of hip cardiac muscle tissue of right atrium parietal pleura veine cave ganglion sensitif d’un nerf spinal Fortement exprimé dans artère carotide externe artère carotide interne Ganglion de Gasser ganglion cervical supérieur ganglion sensitif d’un nerf spinal tube neural cheville lumbar spinal ganglion subcutaneous adipose tissue tissu adipeux brun Plus de données d'expression de référence BioGPS n/a
Gene Ontology Fonction moléculaire liaison ADN liaison protéique liaison ion métal DNA-binding transcription factor activity protein dimerization activity DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific C2H2 zinc finger domain binding DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific Composant cellulaire noyau Processus biologique développent d'un organisme multicellulaire regulation of transcription, DNA-templated transcription, DNA-templated regulation of transcription by RNA polymerase II positive regulation of transcription by RNA polymerase II Sources:Amigo / QuickGO
Orthologues Espèces Homme Souris Entrez 1879 13591 Ensembl ENSG00000164330 ENSMUSG00000057098 UniProt Q9UH73 Q07802 RefSeq (mRNA) NM_001290360 NM_024007 NM_182708 NM_001324101 NM_001324103 NM_001324106 NM_001324107 NM_001324108 NM_001324109 NM_001324111 NM_001364155 NM_001364156 NM_001364157 NM_001364158 NM_001364159 NM_001290709 NM_001290710 NM_001290711 NM_007897 RefSeq (protéine) NP_001277289 NP_001311030 NP_001311032 NP_001311035 NP_001311036 NP_001311037 NP_001311038 NP_001311040 NP_076870 NP_874367 NP_001351084 NP_001351085 NP_001351086 NP_001351087 NP_001351088 NP_001277638 NP_001277639 NP_001277640 NP_031923 NP_001349498 NP_001349500 NP_001349503 NP_001349504 NP_001349505 NP_001349506 NP_001349507 NP_001349508 Localisation (UCSC) Chr 5: 158.7 – 159.1 Mb Chr 11: 44.62 – 45.01 Mb Publication PubMed [3] [4]
Wikidata
Voir/Editer Humain Voir/Editer Souris

Le facteur de transcription COE1 est une protéine codée par le gène EBF1 chez l'homme. EBF1 est le sigle anglais de Early B-Cell Factor 1^[5],[6],[7].

Interactions

Il fut montré qu'EBF1 interagit avec ZNF423^[8] et CREB^[9].

Notes et références

1. GRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000164330 - Ensembl, May 2017
2. GRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000057098 - Ensembl, May 2017
3. « Publications PubMed pour l'Homme », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
4. « Publications PubMed pour la Souris », sur National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine
5. « Symbol Report: EBF1 »
6. « Gene for a tissue-specific transcriptional activator (EBF or Olf-1), expressed in early B lymphocytes, adipocytes, and olfactory neurons, is located on human chromosome 5, band q34, and proximal mouse chromosome 11 », Mamm. Genome, vol. 5, n^o 4,‎ juillet 1994, p. 211–5 (PMID 8012110, DOI 10.1007/BF00360547)
7. « Entrez Gene: EBF1 early B-cell factor 1 »
8. « Cloning and functional characterization of Roaz, a zinc finger protein that interacts with O/E-1 to regulate gene expression: implications for olfactory neuronal development », J. Neurosci., vol. 17, n^o 11,‎ juin 1997, p. 4159–69 (PMID 9151733)
9. « Inhibition of p300/CBP by early B-cell factor », Mol. Cell. Biol., vol. 23, n^o 11,‎ juin 2003, p. 3837–46 (PMID 12748286, PMCID 155219, DOI 10.1128/MCB.23.11.3837-3846.2003)

Bibliographie

Liens externes

• FactorBook EBF1

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