Emiel Verstrynge commence le sport par le football, mais à l'âge de 14 ans, il choisit finalement le cyclo-cross. Il dispute son premier championnat de Belgique chez les novices en 2018 à Coxyde où il se classe huitième. Un an plus tard, il remporte trois compétitions juniors (17/18 ans), dont le championnat provincial à Hamme. Il remporte deux cyclo-cross lors de la saison 2019-2020 à Gullegem et Vittel. Il termine également troisième du championnat du monde et du Belgique de cyclo-cross juniors. Les deux fois, il est battu par ses compatriotes Thibau Nys et Lennert Belmans. Ses performances suscitent l'intérêt de la nouvelle équipe Wanty-Gobert-Tormans CX. Le jour de son dix-huitième anniversaire, il signé en 2020 un contrat de trois ans avec l'équipe de cyclo-cross dirigée par l'ancien champion Bart Wellens.