L'étymologie du nom de cette famille est la suivante : N.L. neut. n. Flavobacterium, genre type de la famille; L. fem. pl. n. suff. -aceae, suffixe pour définir une famille; N.L. fem. pl. n. Flavobacteriaceae, la famille de Flavobacterium[4].
Publication originale(en) H. Reichenbach, « Order 1. Cytophagales Leadbetter 1974, 99*. », dans Staley JT, Bryant MP, Pfennig N, Holt JG (eds), Bergey's manual of systematic bacteriology, vol. 3, Baltimore, The Williams & Wilkins Co., , p. 2011-2013