En 1863, la commune est créée à partir de sections détachées du Bastit et prend le nom de Fontanes-Lunegarde. En 1933, Lunegarde est détachée de Fontanes qui devient Fontanes-du-Causse[4].
L'évolution du nombre d'habitants est connue à travers les recensements de la population effectués dans la commune depuis 1793. À partir du , les populations légales des communes sont publiées annuellement dans le cadre d'un recensement qui repose désormais sur une collecte d'information annuelle, concernant successivement tous les territoires communaux au cours d'une période de cinq ans.
Pour les communes de moins de 10 000 habitants, une enquête de recensement portant sur toute la population est réalisée tous les cinq ans, les populations légales des années intermédiaires étant quant à elles estimées par interpolation ou extrapolation[6]. Pour la commune, le premier recensement exhaustif entrant dans le cadre du nouveau dispositif a été réalisé en 2005[7],[Note 1].
En 2013, la commune comptait 74 habitants, en évolution de +4,23 % par rapport à 2008 (Lot : +0,05 %, France hors Mayotte : +2,49 %).
Le dolmen de Combescure (aussi appelé Dolmen du Douyounet) : dolmen encore totalement enserré dans son tumulus (16 mètres de diamètre pour 2,5 mètres de haut), la table est une belle dalle de calcaire (4 mètres de long par 3,40 mètres de large) d'un poids estimé à environ 20 tonnes. 44° 40′ 17″ N, 1° 38′ 22″ E
Le dolmen de la Pierre-Levée de Nougayrac : le dolmen dispose d'une table (3,70 mètres de long par 2,50 mètres de large et épaisse de 70 centimètres environ) dont le poids est estimé à 14 tonnes.Classé MH (1989) Notice no PA00095091
L'église Sainte-Anne de Fontanes-du-Causse, rebâtie en 1841 sur des fondations anciennes. Vitraux de 1900.
↑ a et bJean-Maire Cassagne, Villes et Villages en pays lotois, page 115.
↑Gaston Bazalgues, À la découverte des noms de lieux du Quercy : Toponymie lotoise, Gourdon, Éditions de la Bouriane et du Quercy, , 127 p. (ISBN2-910540-16-2), p. 75.
↑Gaston Bazalgues, À la découverte des noms de lieux du Quercy : Toponymie lotoise, Gourdon, Éditions de la Bouriane et du Quercy, , 127 p. (ISBN2-910540-16-2), p. 111
↑Par convention dans Wikipédia, le principe a été retenu de n’afficher dans le tableau des recensements et le graphique, pour les populations légales postérieures à 1999, que les populations correspondant à une enquête exhaustive de recensement pour les communes de moins de 10 000 habitants, et que les populations des années 2006, 2011, 2016, etc. pour les communes de plus de 10 000 habitants, ainsi que la dernière population légale publiée par l’Insee pour l'ensemble des communes.