Il rejoint ensuite l'orchestre national iranien comme soliste puis collabore avec le groupe Sheyda avant de créer le groupe Aref et en 1989 Hamavayan Ensemble. Il y rencontre des musiciens d'envergure tels Mohammad Reza Shadjarian et Parviz Meshkatian.
Alizâdeh a œuvré depuis toujours à faire évoluer la musique iranienne. C'est ainsi que parallèlement à l'approfondissement de ses connaissances sur le répertoire classique et à l'étude historique de son évolution, il a introduit de nouvelles théories tant dans les techniques d'improvisation que dans la composition qu'il évoque lors de ses interventions dans les universités européennes et américaines. Ainsi il est pour beaucoup dans l'émergence d'une nouvelle génération d'interprètes et de professeurs de musique persane.
À l'issue de 30 années d'activité et de création, Hossein Alizâdeh est reconnu aujourd'hui comme un des pionniers les plus marquants de la musique traditionnelle iranienne. Maître incontesté de Târ et Sétâr, ses talents de soliste et de compositeur ont été reconnus par les meilleurs critiques. On peut citer à titre exemple sa collaboration avec Maurice Béjart en compagnie de l'Orchestre de la Télévision Iranienne, ainsi que de nombreux concerts dans les radios européennes et américaines.
World Village Music - Faryad (The Cry), 2005 : MR Shadjarian : voix ; H. Alizadeh : târ ; K. Kalhor : kamânche ; H Shadjarian : voix et tombak
World Village Music - Sallaneh, 2003 : H. Alizadeh : sallaneh
Bi To Be Sar Nemishavad (Without You), 2002 : MR Shadjarian : voix ; H. Alizadeh : târ ; K. Kalhor : kamânche ; H Shadjarian : voix et tombak
Iran : Les Maîtres de l'improvisation, 2002 : H. Alizadeh : târ ; Madjid Khaladj : tombak
World Village Music - Zemestan ast (It's Winter), 2000 : Mehdi Akhavan Sales : poèmes ; MR Shadjarian : voix ; H. Alizadeh : târ ; K. Kalhor : kamânche ; H Shadjarian : voix et tombak
Raz-e No (New Secret), 1999 : H. Alizadeh : compositeur, târ, tambûr ; M. Keramati, A. Rasayi, H. Niknam, A. Samadpour : voix ; D. Zargari : tombak