Jean-Michel Aeby, né le dans le canton de Genève, est un footballeur international (3 sélections) et entraîneur de football suisse.
Il a notamment évolué au Lausanne-Sport et au Servette FC où il a gagné un titre avec ce club champion de Suisse.
Entraîneur du CS Chênois (1L), du FC Meyrin (1L), du Servette (ChL) pendant trois ans, il est engagé ensuite comme entraineur des jeunes pour Neuchâtel Xamax.
En , il est nommé entraîneur de l'équipe A. En , il est remercié à la suite des mauvais résultats obtenus.