Peu d’œuvres du compositeur ont été enregistrées. Toutefois, on trouve son quatuor à cordes en la, l’opéra Ekkehard, la quatrième symphonie Columbus et des œuvres concertantes pour contrebasse et orchestre.
° 2CD de l'opéra Ekkehard, enregistrement 1998 par le label Capriccio, avec Jonas Kaufmann, Nyla von Ingen, Christian Gerhaher sous la direction de Peter Falk - Réédition annoncée pour [1]. Sortie le 20 janvier 2020[2].
Hermann Abert, Johann Joseph Abert (1832–1915): sein Leben und seine Werke, deuxième édition Leipzig Édition. Bad Neustadt a. d. Saale, 1983. ("Beiträge zur Musikgeschichte der Sudetendeutschen", Vol. 1).
Hermann Abert: Johann Joseph Abert (1832–1915). Sein Leben und seine Werke. 2., verb. u. erw. Auflage. Nachdr. d. Ausg. Leipzig. Bad Neustadt a. d. Saale, 1983. (Beiträge zur Musikgeschichte der Sudetendeutschen, Band 1).
Michael Jahn, Clemens Höslinger(de): Vergessen. Vier Opernkomponisten des 19. Jahrhunderts. J. F. Halévy, A. Rubinstein, K. Goldmark und J. J. Abert (= Schriften zur Wiener Operngeschichte, Band 6). Verlag Der Apfel, Wien 2008. (ISBN978-3-85450-288-3)
Anna Amalie Abert: Johann Joseph Abert, ein Circumpolarer zwischen Tradition und Fortschritt, Veröffentlichungen der Johann Josef Abert Gesellschaft, Band 1,Laaber Verlag, Stuttgart, 1988 (OCLC887766742)
Widmar Hader: Werkverzeichnis Johann Joseph Abert Stand 22. Februar 1933, herausgegeben von Johann-Joseph Abert-Gesellschaft (OCLC248431387)
Michael Jahn; Clemens Höslinger: Vergessen: vier Opernkomponisten des 19. Jahrhunderts; J. F. Halévy, A. Rubinstein, K. Goldmark und J. J. Abert. Schriften zur Wiener Operngeschichte, 6. Veröffentlichungen des RISM-Österreich. Verlag Der Apfel, Wien, 2008, (ISBN978-3-854-50288-3)