Les langues Halmahera du Sud sont un sous-groupe des langues halmahera du sud-nouvelle guinée occidentale parlées en Indonésie, dans le sud de l'île de Halmahera et à l'Est.
Au nombre de 7, elles se répartissent ainsi :
L'existence des langues Halmahera du Sud-Nouvelle Guinée occidentale à l'intérieur du malayo-polynésien est assez clairement établi. Blust rassemble l'halmahera du sud-nouvelle guinée occidentale et l'océanien dans un groupe malayo-polynésien oriental. Cette hypothèse n'est pas validée par Ross[1].