Refusant tout lien entre l'intelligence et la taille du cerveau, Gratiolet s'opposa vivement à Paul Broca (1824-1880) sur cette question mais les deux hommes qui, coïncidence, étaient originaires de la même ville, se retrouvèrent sur l'idée que l'aphasie résultait d'une atteinte des lobes frontaux, en particulier gauche, du cerveau.
Recherches sur l'organe de Jacobson, [Thèse pour le doctorat en médecine, présentée et soutenue le ], Impr. Rignoux, 1845.
« Notes sur le système veineux des reptiles », in Journ. de l'Institut, tome 21, p. 60.
« Note sur les expansions des racines cérébrales du nerf optique et sur leur terminaison dans une région déterminée de l’écorce des hémisphères », in Compt. Rend. Acad. Sci., 1854, vol. 39, p. 274-278.
Mémoire sur les plis cérébraux de l'homme et des primates, Paris, A. Bertrand, (lire en ligne).
Notice sur les travaux de M. Pierre Gratiolet, Paris, Félix Malteste et Cie, (lire en ligne).
« Note sur les effets qui suivent l'ablation des capsules surrénales », in CR Soc. Biol.(Paris), 1856, vol. 43, p. 468-470.
« Mémoire sur le développement de la forme du crâne de l'Homme et sur quelques variations qu'on observe dans la marche de l'ossification de ses sutures », in Comptes rendus hebdomadaires des séances de l'académie des sciences, 1856, vol. 43, no S 428.
Recherches sur le système vasculaire de la Sangsue médicinale et de l'Aulastome vorace. Suivi de Propositions de zoologie, de botanique et de géologie données par la faculté, Paris, L. Martinet, (lire en ligne).
Titres scientifiques de M. Pierre Gratiolet, Paris, Mallet-Bachelier, (lire en ligne).
« Comparaison du bras et de la main de l'Homme avec l'avant-bras et la main des grands Singes à sternum plat », in Comptes Rendus de l'Académie des sciences, 1864, p. 321-24.
De la physionomie et des mouvements d'expression, [suivi d'une Notice sur sa vie et ses travaux, et de la nomenclature de ses ouvrages, par Louis Grandeau], J. Hetzel (Paris), 1865, lire en ligne sur Gallica.
Recherches sur l'anatomie du Troglodytes aubryi, chimpanzé d'une espèce nouvelle, Paris, Guérin, (lire en ligne).
Recherches sur l'anatomie de l'hippopotame [publiées par les soins du Dr Edmond Alix], V. Masson (Paris), 1867, lire en ligne sur Gallica.
En collaboration
avec François Leuret : Anatomie comparée du système nerveux considéré dans ses rapports avec l’intelligence, J.B. Ballière (Paris), 1839-1857:
↑Les "radiations optiques de Gratiolet" (ou tractus géniculo-calarine) forment un faisceaux de fibres nerveuses entre le corps genouillé latéral et le cortex visuel primaire.
A. C.: « Gratiolet Louis-Pierre », in :Dictionnaire encyclopédique des sciences médicales, Quatrième série, F-K. Tome dixième, GOU-GRO, publ. sous la dir. de A. Dechambre [puis de] L. Lereboullet ; L. Hahn secrétaire de la dir. [puis] directeur-adjoint, G. Masson (Paris),P. Asselin (Paris) [puis] Asselin et Houzeau (Paris), 1877-1889, p. 334-36, lire en ligne sur Gallica.
Paul Pierre Broca, Éloge funèbre de Pierre Gratiolet prononcé sur sa tombe le , imp. Martinet (Paris), 1865, Texte intégral.
P. Bertillon, «Gratiolet, sa vie et ses œuvres», in: Gazette hebdomadaire de médecine, 1865, 2 , 161 et 177.
Louis Grandeau, Pierre Gratiolet : sa vie et ses travaux, J. Hetzel (Paris), 1865, Texte intégral.
Paul Bert, Éloge de Pierre Gratiolet, [prononcé le à la séance publique annuelle de la Société de secours des Amis des sciences], impr. de C. Lahure (Paris), 1866, lire en ligne sur Gallica.
Edmond Alix, Notice sur les travaux anthropologiques de Gratiolet [lue dans la séance solennelle du ], A. Hennuyer, 1869,Texte intégral.
Edmond Alix: «Réponse aux attaques dirigées contre M. Gratiolet par M. Vogt, dans la préface de ses Leçons sur l'homme», in: Bulletins de la Société d'anthropologie de Paris, I° Série. Tome 6, 1865. pp. 205–220. doi : 10.3406/bmsap.1865.9478 , Texte intégral.
Joachim Giraldès (1808-1875), Éloge de Gratiolet : prononcé à la séance annuelle de la Société anatomique (1866), impr. de Goupy (Paris), 1867, lire en ligne sur Gallica.
Abbé Lenoir, «Gratiolet (Louis-Pierre)», in: Nicolas Bergier (1718-1790):Dictionnaire de théologie approprié au mouvement intellectuel de la seconde moitié du XIXe siècle, L. Vivès (Paris),1873-1882, Tome 6, 163-4, lire en ligne sur Gallica.
(en) J.M.S. Pearce: «Louis Pierre Gratiolet (1815-1865): The Cerebral Lobes and Fissures», in: European Neurology, Vol. 56, No. 4, 2006, 2e partie, p. 85-110]Texte intégral.