Magnus Manske
| Naissance | |
|---|---|
| Nom de naissance |
Heinrich Magnus Manske |
| Nationalité | |
| Formation |
Hölderlin Gymnasium (d) (- Université de Cologne (doctorat) (- |
| Activités |
Développeur informatique, informaticien, wikimédien, bio-informaticien, biochimiste, biologiste |
| A travaillé pour |
Centre Sanger (depuis ) |
|---|---|
| Directeur de thèse |
Helmut W. Klein (d) |
| Site web |
(en) magnusmanske.de |
| Blog officiel |
Heinrich Magnus Manske (né en à Cologne en Allemagne) est un biochimiste et un développeur allemand. Il est l'auteur de l'une des premières versions de MediaWiki, le moteur de Wikipédia.
Biographie
[modifier | modifier le code]Magnus Manske étudie la biochimie à l'université de Cologne en Allemagne où il obtient son doctorat en 2006 ; sa dissertation porte sur un logiciel publié sous licence libre, « GENtle », pouvant servir en biologie moléculaire[1],[2],[3].
Depuis , il travaille pour le Wellcome Trust Sanger Institute à Cambridge en Angleterre, mais continue à créer et maintenir des outils pour Wikipédia[4].
Pendant ses études universitaires, Manske participe à Nupedia et met au point des outils et des extensions pour le projet. Plus tard, il met au point l'une des premières versions de ce qui sera appelé « MediaWiki »[5].
Le premier moteur de Wikipédia, UseModWiki, a été rédigé en Perl. Pendant l'été 2002, confronté aux problèmes issus de l'usage de plus en plus grand de Wikipédia, Manske commence à travailler sur un substitut à UseModWiki, qui ferait appel à un SGDB et comprendrait des fonctions propres à Wikipédia[6]. Le , il publie la première version d'un moteur de wiki, appelé « Phase II », écrit en PHP qui a recours à MySQL[7],[8]. Dans cette mouture, Manske introduit les espaces de noms, ce qui permet de maintenir et de distinguer, par exemple, les articles des pages de discussion et des pages utilisateur ; dans UseModWiki, cette distinction n'existait pas[6]. Phase II introduit aussi le téléchargement des fichiers, les listes de suivi, la signature automatique et les historiques de contributions[9],[10].
Phase II ne pouvant répondre aux sollicitations de plus en plus fréquentes des pages de Wikipédia, Lee Daniel Crocker réécrit le moteur, appelé Phase III, qui est utilisé à partir de . C'est en 2003 que le moteur est appelé « MediaWiki »[8].
Magnus Manske a par la suite créé des outils et des extensions pour MediaWiki, dont un qui montre la répartition géographique des contributeurs sur une carte, un autre qui sert à recouper des catégories et un troisième qui facilite l'import d'illustrations depuis Flickr vers Wikimedia Commons[11],[12]. Il a aussi mis au point l'extension Cite[13] qui permet d'insérer les références en utilisant une syntaxe de style XML[14].
Manske est favorable au mouvement des logiciels libres et met régulièrement les logiciels qu'il conçoit sous GPL. Les premières versions de MediaWiki ont été publiées sous GPL[15].
Publications
[modifier | modifier le code]Cette section comprend quelques articles et ouvrages rédigés par Magnus Manske, seul ou en collaboration.
- Magnus Manske, Olivo Miotto, Susana Campino et al., « Analysis of Plasmodium falciparum diversity in Natural Infections by Deep Sequencing », Nature, vol. 487, no 7407, , p. 375-379 (PMID 22722859, DOI 10.1038/nature11174)
- Magnus Manske et Dominic P. Kwiatkowski, « LookSeq: A browser-based viewer for deep sequencing data », Genome Research, vol. 19, no 11, , p. 2125-2132 (PMID 19679872, PMCID 2775587, DOI 10.1101/gr.093443.109)
- Magnus Manske et Dominic P. Kwiatkowski, « SNP-o-matic », Bioinformatics, vol. 25, no 18, , p. 2434-2435 (PMID 19574284, PMCID 2735664, DOI 10.1093/bioinformatics/btp403)
- (en) Timothy Robinson, Susana G. Campino,Sarah Auburn,Samuel A. Assefa, Spencer D. Polley, Magnus Manske, Bronwyn MacInnis, Kirk A. Rockett, Gareth L. Maslen, Mandy Sanders, Michael A. Quail, Peter L. Chiodini, Dominic P. Kwiatkowski, Taane G. Clark, Colin J. Sutherland, « Drug-Resistant Genotypes and Multi-Clonality in Plasmodium falciparum Analysed by Direct Genome Sequencing from Peripheral Blood of Malaria Patients », PLOS ONE, (lire en ligne)
- (en) Magnus Manske, GENtle, a free multi-purpose molecular biology tool, université de Cologne, (lire en ligne)
Distinctions
[modifier | modifier le code]- En 2002, Jimmy Wales a nommé le comme Magnus Manske day (« Jour de Magnus Manske ») pour souligner ses contributions à Wikipédia[16],[17].
- Larry Sanger, dans ses mémoires sur les premiers jours de l'histoire de Wikipédia, a souligné les contributions de Magnus Manske et attribue une part des succès du projet à un petit groupe de contributeurs, dans lequel Manske a joué un rôle important :
« Wikipédia a commencé avec quelques personnes, plusieurs provenant de Nupedia. L'influence des Nupedians fut capitale. Je me souviens, particulièrement, de l'infatigable Magnus Manske (qui a travaillé sur le logiciel pour les deux projets), de notre résidente et rigoureuse Ruth Ifcher et de notre très bon joueur de poker, le programmeur Lee Daniel Crocker -- pour n'en nommer que quelques-uns... C'est le fait d'avoir commencé ce projet avec ces bonnes personnes et que nous ayons ajusté, expliqué et promu de bonnes habitudes et politiques auprès des nouvelles personnes, qui explique en partie pourquoi le projet a développé une communauté robuste et fonctionnelle, laquelle a obtenu le succès[trad 1],[18]. »
- Le travail de Magnus Manske et d'autres a été reconnu par le USENIX Advanced Computing Technical Association, qui leur a remis le STUG award en pour leurs contributions au logiciel de Wikipédia. Manske a été reconnu comme un contributeur majeur de MediaWiki[19].
Notes et références
[modifier | modifier le code]Citations originales
[modifier | modifier le code]- (en) « Wikipedia started with a handful of people, many from Nupedia. The influence of Nupedians was crucial early on. I think, especially, of the tireless Magnus Manske (who worked on the software for both projects), our resident stickler Ruth Ifcher, and the very smart poker-playing programmer Lee Daniel Crocker—to name a few...But the facts that the project started with these good people, and that we were able to adopt, explain, and promote good habits and policies to newer people, partly accounts for why the project was able to develop a robust, functional community and eventually to succeed. »
Références
[modifier | modifier le code]- (en) Magnus Manske, GENtle, a free multi-purpose molecular biology tool, université de Cologne, (lire en ligne)
- (en) Magnus Manske, « GENtle » (consulté le )
- (en) Alastair Kerr, « Desktop Sequence Analysis: software review », sur Bioinformatics Knowledge Blog, (consulté le )
- (en) Magnus Manske, « Magnus Manske » (consulté le )
- (en) Jennifer Joline Anderson, Wikipedia : The Company and Its Founders, ABDO, , 112 p. (ISBN 978-1-61714-812-5, lire en ligne), p. 44
- (en) Sumana Harihareswara, Guillaume Paumier, Amy Brown (dir.) et Greg Wilson (dir.), The Architecture of Open Source Applications, Kristian Hermansen, , 374 p. (ISBN 978-1-105-57181-7, lire en ligne), « MediaWiki »
- (en) Andrew Lih, The Wikipedia Revolution : How a Bunch of Nobodies Created the World's Greatest Encyclopedia, Hyperion, , 246 p. (ISBN 978-1-4013-0371-6)
- (en) Rajeev Kumar, « Wiki Installation and Customization », INFLIBNET's Institutional Repository, (lire en ligne, consulté le )
- (en) (Contributeurs), « Wikipedia:PHP script new features », (consulté le )
- (en) Magnus Manske, « [Wikipedia-l] New features list », (consulté le )
- (en) « Magnus' toys'n'tools » (consulté le )
- (en) « Magnus' tools on wmflabs » (consulté le )
- (en) Extension:Cite, MediaWiki.org, 20 juin 2013
- [PDF] (en) Mathias Schindler et Denny Vrandečić, « Introducing new features to Wikipedia », dans Jim Hendler et Helen Margetts, Proceedings of the First International Conference on Web Sciences WebSci09, Athènes, Grèce, (lire en ligne)
- (en) N. A. Polukarova, « The concept of open editing from the copyright viewpoint », Automatic Documentation and Mathematical Linguistics, Allerton Press, Inc., vol. 41, no 3, , p. 104-107 (ISSN 1934-8371, DOI 10.3103/S0005105507030053) :
« In simpler words, while the developers of proprietary programs use their copyrights to deprive most of the users of most of their freedoms, GPL adherents, including above-mentioned Magnus Manske, use these privileges to guarantee these freedoms to users. »
- (en) « [Wikipedia-l] Celebration », (consulté le )
- (en) « Wikipedia:Magnus Manske Day » (consulté le )
- (en) Larry Sanger, « The Early History of Nupedia and Wikipedia: A Memoir », (consulté le )
- (en) « STUG Award », USENIX (consulté le )
Voir aussi
[modifier | modifier le code]Articles connexes
[modifier | modifier le code]Liens externes
[modifier | modifier le code]
- (en) Site officiel
- Ressources relatives à la recherche :
- (en) Entrée sur malariagen.net
